More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2713 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  1028    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  46.74 
 
 		 493 aa  425  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  46.53 
 
 		 493 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  45.32 
 
 		 478 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  44.79 
 
 		 478 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  44.12 
 
 		 481 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  44.12 
 
 		 481 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  43.49 
 
 		 481 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 		 482 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  43.07 
 
 		 481 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  45.13 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  45.13 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  47.59 
 
 		 478 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  41.54 
 
 		 477 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  43.61 
 
 		 497 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  43.61 
 
 		 497 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  43.4 
 
 		 482 aa  363  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  38.82 
 
 		 472 aa  335  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  38.82 
 
 		 472 aa  335  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  39 
 
 		 486 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  39 
 
 		 486 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  39 
 
 		 486 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  39 
 
 		 486 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  39 
 
 		 486 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  39 
 
 		 486 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  39 
 
 		 486 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  39 
 
 		 486 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  39 
 
 		 486 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  39 
 
 		 486 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  39 
 
 		 486 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  38.8 
 
 		 486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  38.8 
 
 		 486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  38.95 
 
 		 472 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  37.66 
 
 		 473 aa  295  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3726  transposase, IS4 family protein  42.71 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1199  transposase, IS4  44.44 
 
 		 334 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5780  transposase IS4 family protein  39.37 
 
 		 351 aa  238  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0758  putative transposase IS4  44.85 
 
 		 275 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0860229 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2404  hypothetical protein  45.19 
 
 		 251 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0759  putative transposase  45.99 
 
 		 195 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3565  hypothetical protein  41.74 
 
 		 249 aa  183  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2433  transposase, IS4  57.46 
 
 		 150 aa  166  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119357  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0340  transposase IS4 family protein  26.71 
 
 		 455 aa  128  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0534  putative transposase  25.34 
 
 		 516 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1383  putative transposase or inactivated derivative  25.54 
 
 		 516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3038  IS4 family transposase  25.54 
 
 		 516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3052  IS4 family transposase  25.54 
 
 		 516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0529  putative transposase  25.54 
 
 		 516 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0927  transposase IS4 family protein  26.65 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4639  transposase IS4 family protein  26.65 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4611  transposase IS4 family protein  26.65 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.239615  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8073  transposase IS4 family protein  26.65 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3057  transposase IS4 family protein  26.65 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3346  transposase IS4 family protein  26.65 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6639  transposase IS4 family protein  26.65 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1571  transposase IS4 family protein  26.6 
 
 		 513 aa  120  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0160489  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1169  transposase IS4 family protein  25.66 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000912267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1496  transposase IS4 family protein  25.45 
 
 		 445 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000517789  hitchhiker  0.0000000823353 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0625  transposase IS4 family protein  25.25 
 
 		 445 aa  118  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000035382  unclonable  0.0000000000654827 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2261  transposase IS4 family protein  26.49 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1576  transposase IS4 family protein  26.49 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0562343  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2272  transposase IS4 family protein  26.49 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0227  transposase IS4 family protein  26.49 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2464  transposase IS4 family protein  26.49 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0786  transposase IS4 family protein  26.49 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.980261  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  26.32 
 
 		 457 aa  116  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  26.32 
 
 		 457 aa  116  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  26.32 
 
 		 457 aa  116  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  26.32 
 
 		 457 aa  116  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2634  transposase, IS4 family protein  25.75 
 
 		 509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1439  transposase IS4 family protein  25.54 
 
 		 535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0574  transposase IS4 family protein  25.95 
 
 		 455 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1480  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2817  transposase  27.56 
 
 		 649 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000632449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0846  ISBma2, transposase  27.92 
 
 		 487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0106  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000024097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1107  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000102477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3154  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000034185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3479  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000173185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3601  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3534  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000144429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3504  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000103535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0019  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000185671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0526  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000180348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0861  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000191702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0874  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0896  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1013  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000243207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1108  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00911863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1128  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000155023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1649  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000032724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1836  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000324968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2120  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000261492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2241  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000418169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2580  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000022544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2682  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000383398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2763  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000207771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3228  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000223138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3562  transposase  27.35 
 
 		 493 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1524  transposase  27.15 
 
 		 493 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>