More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0759 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0759  putative transposase  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1199  transposase, IS4  86.02 
 
 		 334 aa  340  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  80.11 
 
 		 481 aa  325  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  78.72 
 
 		 481 aa  323  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  78.72 
 
 		 481 aa  323  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  79.57 
 
 		 481 aa  322  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  79.03 
 
 		 482 aa  315  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  69.73 
 
 		 478 aa  291  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  69.19 
 
 		 478 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  76.19 
 
 		 482 aa  282  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  70.27 
 
 		 493 aa  275  3e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  69.73 
 
 		 493 aa  274  8e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  69.35 
 
 		 497 aa  251  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  69.35 
 
 		 497 aa  251  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  60.33 
 
 		 477 aa  247  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2404  hypothetical protein  60.31 
 
 		 251 aa  245  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  67.03 
 
 		 478 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3726  transposase, IS4 family protein  57.73 
 
 		 390 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  60.64 
 
 		 479 aa  229  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  60.64 
 
 		 479 aa  229  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2433  transposase, IS4  72.66 
 
 		 150 aa  223  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119357  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  48.39 
 
 		 486 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  48.39 
 
 		 486 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  48.39 
 
 		 486 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  48.39 
 
 		 486 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  48.39 
 
 		 486 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  48.39 
 
 		 486 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  48.39 
 
 		 486 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  48.39 
 
 		 486 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  48.39 
 
 		 486 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  48.39 
 
 		 486 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  48.39 
 
 		 486 aa  197  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  47.85 
 
 		 486 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  47.85 
 
 		 486 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  47.54 
 
 		 472 aa  195  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  47.54 
 
 		 472 aa  195  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  48.09 
 
 		 472 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  46.96 
 
 		 473 aa  180  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  45.99 
 
 		 499 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0139  ISPsy6 transposase  67.03 
 
 		 94 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1169  transposase IS4 family protein  30.94 
 
 		 445 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000912267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0625  transposase IS4 family protein  30.94 
 
 		 445 aa  104  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000035382  unclonable  0.0000000000654827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1496  transposase IS4 family protein  30.94 
 
 		 445 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000517789  hitchhiker  0.0000000823353 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8445  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 444 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7792  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 444 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275885  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7909  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 444 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0378825  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8347  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 444 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6465  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 444 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2029  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 444 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.843963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2233  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 444 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8505  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 444 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8169  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 444 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7502  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 444 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6804  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 444 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7596  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 444 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7856  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 444 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0645  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 444 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8135  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 444 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2688  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 444 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0788  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 444 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4867  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4843  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0683585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0308  transposase IS4 family protein  34.87 
 
 		 444 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8194  transposase IS4 family protein  34.87 
 
 		 444 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558489  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0903  transposase IS4 family protein  34.87 
 
 		 444 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3217  transposase IS4 family protein  34.87 
 
 		 444 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7986  transposase IS4 family protein  34.87 
 
 		 444 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4108  hypothetical protein  47.52 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1840  transposase IS1182 family protein  31.46 
 
 		 447 aa  92.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0171  transposase IS1182 family protein  31.46 
 
 		 447 aa  92.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3052  transposase IS1182 family protein  31.46 
 
 		 447 aa  92.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000434143  normal  0.286719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2711  transposase IS1182 family protein  31.46 
 
 		 447 aa  92.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2730  transposase IS1182 family protein  31.46 
 
 		 447 aa  92.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.271694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2657  transposase IS1182 family protein  31.46 
 
 		 447 aa  92.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817106  normal  0.241494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1782  transposase IS1182 family protein  31.46 
 
 		 447 aa  92.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0426  transposase  30.37 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1665  transposase IS1182 family protein  31.46 
 
 		 447 aa  92  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1107  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  91.7  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000102477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3504  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000103535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2580  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000022544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0019  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000185671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0526  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000180348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1013  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000243207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0896  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0874  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1108  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00911863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1480  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1128  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000155023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0861  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000191702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2241  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000418169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2120  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000261492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2763  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000207771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3228  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000223138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2682  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000383398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1836  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000324968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3601  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3534  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000144429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3479  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000173185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1649  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 452 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000032724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1929  IS4 family transposase  32.95 
 
 		 353 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.121993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>