104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0139 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0139  ISPsy6 transposase  100 
 
 		 94 aa  192  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  80.22 
 
 		 493 aa  150  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  80.22 
 
 		 493 aa  150  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  79.12 
 
 		 478 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  80.22 
 
 		 478 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  74.73 
 
 		 482 aa  142  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  68.13 
 
 		 481 aa  140  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0759  putative transposase  67.03 
 
 		 195 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  69.23 
 
 		 481 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  69.23 
 
 		 481 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2433  transposase, IS4  71.43 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119357  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  67.03 
 
 		 481 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1199  transposase, IS4  65.93 
 
 		 334 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  62.64 
 
 		 477 aa  120  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2404  hypothetical protein  60.44 
 
 		 251 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3726  transposase, IS4 family protein  60.44 
 
 		 390 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  53.41 
 
 		 472 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  53.41 
 
 		 472 aa  105  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  65.93 
 
 		 478 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  52.27 
 
 		 486 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  52.27 
 
 		 486 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  52.27 
 
 		 486 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  52.27 
 
 		 486 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  52.27 
 
 		 486 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  52.27 
 
 		 486 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  52.27 
 
 		 486 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  52.27 
 
 		 486 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  52.27 
 
 		 486 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  52.27 
 
 		 486 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  52.27 
 
 		 486 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  63.74 
 
 		 482 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  51.14 
 
 		 486 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  51.14 
 
 		 486 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  51.14 
 
 		 472 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  55.95 
 
 		 473 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  67.82 
 
 		 479 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  67.82 
 
 		 479 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  63.74 
 
 		 497 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  63.74 
 
 		 497 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4867  hypothetical protein  53.33 
 
 		 102 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  55.17 
 
 		 499 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1169  transposase IS4 family protein  38.75 
 
 		 445 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000912267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0625  transposase IS4 family protein  38.75 
 
 		 445 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000035382  unclonable  0.0000000000654827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1496  transposase IS4 family protein  38.75 
 
 		 445 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000517789  hitchhiker  0.0000000823353 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0443  transposase  37.23 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0045  hypothetical protein  32.95 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000482488  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0106  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000024097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3154  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000034185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3408  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0019  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000185671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0526  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000180348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0861  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000191702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0874  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0896  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1013  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000243207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1107  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000102477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1108  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00911863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1128  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000155023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1480  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1649  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000032724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1836  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000324968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2120  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000261492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2241  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000418169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2580  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000022544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2682  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000383398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2763  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000207771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3228  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000223138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3479  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000173185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3504  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000103535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3534  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000144429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3601  transposase, IS4 family protein  34.44 
 
 		 452 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227766  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1112  transposase IS1182 family protein  35 
 
 		 427 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1616  transposase IS1182 family protein  35 
 
 		 427 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.452366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1776  transposase IS1182 family protein  35 
 
 		 427 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2937  transposase IS1182 family protein  35 
 
 		 427 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4390  transposase IS1182 family protein  35 
 
 		 427 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1805  transposase IS4 family protein  33.75 
 
 		 427 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1809  transposase IS4 family protein  33.75 
 
 		 427 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0317201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2750  transposase IS4 family protein  33.75 
 
 		 427 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3098  transposase IS4 family protein  33.75 
 
 		 419 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3348  transposase IS4 family protein  33.75 
 
 		 427 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3419  transposase IS4 family protein  33.75 
 
 		 427 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3643  transposase IS4 family protein  33.75 
 
 		 427 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0789536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3866  transposase IS4 family protein  33.75 
 
 		 427 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4174  transposase IS4 family protein  33.75 
 
 		 427 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129293  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1571  transposase IS4 family protein  34.83 
 
 		 513 aa  44.3  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0160489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2458  IS4 family transposase  32.05 
 
 		 517 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000853603  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3214  ISPsy22, transposase truncated  39.74 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2634  transposase, IS4 family protein  33.73 
 
 		 509 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0328  transposase IS4 family protein  35.53 
 
 		 450 aa  42.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2267  transposase IS4 family protein  35.53 
 
 		 450 aa  42.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2276  transposase IS4 family protein  35.53 
 
 		 450 aa  42.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0426  transposase  33.33 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0171  transposase IS1182 family protein  31.52 
 
 		 447 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1782  transposase IS1182 family protein  31.52 
 
 		 447 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1840  transposase IS1182 family protein  31.52 
 
 		 447 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2657  transposase IS1182 family protein  31.52 
 
 		 447 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817106  normal  0.241494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2711  transposase IS1182 family protein  31.52 
 
 		 447 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2730  transposase IS1182 family protein  31.52 
 
 		 447 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.271694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3052  transposase IS1182 family protein  31.52 
 
 		 447 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000434143  normal  0.286719 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>