More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0426 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0426  transposase  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3601  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3534  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000144429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3504  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000103535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3479  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000173185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0019  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000185671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0526  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000180348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0861  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000191702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0874  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0896  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1013  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000243207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1108  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00911863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1128  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000155023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1480  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1649  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000032724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1836  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000324968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2120  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000261492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2241  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000418169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2580  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000022544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2682  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000383398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2763  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000207771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3228  transposase, IS4 family protein  58.62 
 
 		 452 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000223138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0106  transposase, IS4 family protein  58.13 
 
 		 452 aa  255  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000024097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3154  transposase, IS4 family protein  58.13 
 
 		 452 aa  255  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000034185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3408  transposase, IS4 family protein  58.13 
 
 		 452 aa  255  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1107  transposase, IS4 family protein  58.13 
 
 		 452 aa  255  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000102477  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1571  transposase IS4 family protein  61.58 
 
 		 513 aa  254  8e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0160489  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0227  transposase IS4 family protein  59.11 
 
 		 455 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2464  transposase IS4 family protein  59.11 
 
 		 455 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2272  transposase IS4 family protein  59.11 
 
 		 455 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1576  transposase IS4 family protein  59.11 
 
 		 455 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0562343  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2261  transposase IS4 family protein  59.11 
 
 		 455 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0574  transposase IS4 family protein  59.11 
 
 		 455 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0786  transposase IS4 family protein  59.11 
 
 		 455 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.980261  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0340  transposase IS4 family protein  58.13 
 
 		 455 aa  249  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258207  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2634  transposase, IS4 family protein  57.89 
 
 		 509 aa  243  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0443  transposase  72.3 
 
 		 163 aa  218  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3052  transposase IS1182 family protein  43.35 
 
 		 447 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000434143  normal  0.286719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0171  transposase IS1182 family protein  43.35 
 
 		 447 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2730  transposase IS1182 family protein  43.35 
 
 		 447 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.271694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2711  transposase IS1182 family protein  43.35 
 
 		 447 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1665  transposase IS1182 family protein  43.35 
 
 		 447 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1782  transposase IS1182 family protein  43.35 
 
 		 447 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1840  transposase IS1182 family protein  43.35 
 
 		 447 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2657  transposase IS1182 family protein  43.35 
 
 		 447 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817106  normal  0.241494 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3863  transposase IS4 family protein  43 
 
 		 440 aa  164  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4074  transposase IS4 family protein  43 
 
 		 440 aa  162  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0982  transposase, IS4 family protein  43.94 
 
 		 441 aa  158  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.261869  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7596  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 444 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8445  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 444 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6465  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 444 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7856  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 444 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8347  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 444 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2233  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 444 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7502  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 444 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121497  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8505  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 444 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7792  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 444 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275885  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7909  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 444 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0378825  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8135  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 444 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0645  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 444 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6804  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 444 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0788  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 444 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140519  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8169  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 444 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2029  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 444 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.843963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2688  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 		 444 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4843  transposase IS4 family protein  39.66 
 
 		 444 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0683585 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1169  transposase IS4 family protein  30.19 
 
 		 445 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000912267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3217  transposase IS4 family protein  41.29 
 
 		 444 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0308  transposase IS4 family protein  41.29 
 
 		 444 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8194  transposase IS4 family protein  41.29 
 
 		 444 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558489  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7986  transposase IS4 family protein  41.29 
 
 		 444 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0903  transposase IS4 family protein  41.29 
 
 		 444 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0625  transposase IS4 family protein  30.19 
 
 		 445 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000035382  unclonable  0.0000000000654827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1496  transposase IS4 family protein  30.19 
 
 		 445 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000517789  hitchhiker  0.0000000823353 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0145  transposase  34.52 
 
 		 545 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0416  transposase  34.52 
 
 		 545 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.415118 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1176  transposase  34.52 
 
 		 545 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1524  transposase  34.52 
 
 		 545 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.419184  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2792  transposase  34.52 
 
 		 545 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.120624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3115  transposase  34.52 
 
 		 545 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.960078  hitchhiker  0.00180053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  31.22 
 
 		 481 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  31.22 
 
 		 481 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  30.65 
 
 		 481 aa  99.4  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  31.25 
 
 		 482 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  30.11 
 
 		 481 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0009  transposase, IS4  34.64 
 
 		 536 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.272991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0072  transposase, IS4  34.64 
 
 		 536 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.173128  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0183  transposase, IS4  34.64 
 
 		 536 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0269  transposase, IS4  34.64 
 
 		 536 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.464686  normal  0.0269922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0350  transposase, IS4  34.64 
 
 		 536 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0387  transposase, IS4  34.64 
 
 		 536 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0612523  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0412  transposase, IS4  34.64 
 
 		 536 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185935  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0439  transposase, IS4  34.64 
 
 		 536 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0484  transposase, IS4  34.64 
 
 		 536 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0590  transposase, IS4  34.64 
 
 		 536 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.366891  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0628  transposase, IS4  34.64 
 
 		 536 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378407  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0697  transposase, IS4  34.64 
 
 		 536 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.876809  normal  0.052348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2025  transposase, IS4  34.64 
 
 		 536 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.469241  normal  0.684714 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2643  transposase, IS4  34.64 
 
 		 536 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3125  transposase, IS4  34.64 
 
 		 536 aa  94.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000237223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>