More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2433 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2433  transposase, IS4  100 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  78.42 
 
 		 482 aa  241  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  74.1 
 
 		 481 aa  233  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  73.38 
 
 		 481 aa  230  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  72.66 
 
 		 481 aa  229  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  72.66 
 
 		 481 aa  229  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  73.61 
 
 		 478 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1199  transposase, IS4  68.49 
 
 		 334 aa  225  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  74.1 
 
 		 478 aa  225  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0759  putative transposase  72.66 
 
 		 195 aa  223  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  71.94 
 
 		 493 aa  211  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  71.22 
 
 		 493 aa  210  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  77.7 
 
 		 482 aa  210  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  76.26 
 
 		 497 aa  201  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  76.26 
 
 		 497 aa  201  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  63.31 
 
 		 477 aa  197  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  71.72 
 
 		 478 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2404  hypothetical protein  64.49 
 
 		 251 aa  194  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3726  transposase, IS4 family protein  64.58 
 
 		 390 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  64.03 
 
 		 479 aa  175  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  64.03 
 
 		 479 aa  175  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  53.9 
 
 		 472 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  53.9 
 
 		 472 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  52.6 
 
 		 486 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  52.6 
 
 		 486 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  52.6 
 
 		 486 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  52.6 
 
 		 486 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  52.6 
 
 		 486 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  52.6 
 
 		 486 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  52.6 
 
 		 486 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  52.6 
 
 		 486 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  52.6 
 
 		 486 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  52.6 
 
 		 486 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  52.6 
 
 		 486 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  51.95 
 
 		 486 aa  160  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  51.95 
 
 		 486 aa  160  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  51.95 
 
 		 472 aa  160  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  48.28 
 
 		 473 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  57.46 
 
 		 499 aa  143  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0139  ISPsy6 transposase  71.43 
 
 		 94 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4867  hypothetical protein  53.19 
 
 		 102 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1169  transposase IS4 family protein  32.35 
 
 		 445 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000912267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1496  transposase IS4 family protein  32.35 
 
 		 445 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000517789  hitchhiker  0.0000000823353 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0625  transposase IS4 family protein  30.47 
 
 		 445 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000035382  unclonable  0.0000000000654827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2458  IS4 family transposase  39.05 
 
 		 517 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000853603  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4843  transposase IS4 family protein  32.14 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0683585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0788  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0645  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2029  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.843963  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8347  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553537  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0171  transposase IS1182 family protein  32.81 
 
 		 447 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1665  transposase IS1182 family protein  32.81 
 
 		 447 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2657  transposase IS1182 family protein  32.81 
 
 		 447 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817106  normal  0.241494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2730  transposase IS1182 family protein  32.81 
 
 		 447 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.271694 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8505  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1782  transposase IS1182 family protein  32.81 
 
 		 447 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2711  transposase IS1182 family protein  32.81 
 
 		 447 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7792  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275885  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3052  transposase IS1182 family protein  32.81 
 
 		 447 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000434143  normal  0.286719 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7856  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7909  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0378825  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8135  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36028  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8169  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2688  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2233  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6465  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7502  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6804  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7596  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8445  transposase IS4 family protein  31.91 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1840  transposase IS1182 family protein  32.81 
 
 		 447 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1929  IS4 family transposase  37.93 
 
 		 353 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.121993 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0443  transposase  37.38 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0308  transposase IS4 family protein  30 
 
 		 444 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0903  transposase IS4 family protein  30 
 
 		 444 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7986  transposase IS4 family protein  30 
 
 		 444 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8194  transposase IS4 family protein  30 
 
 		 444 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558489  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3217  transposase IS4 family protein  30 
 
 		 444 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3348  transposase IS4 family protein  34.26 
 
 		 427 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3866  transposase IS4 family protein  34.26 
 
 		 427 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3643  transposase IS4 family protein  34.26 
 
 		 427 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0789536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3419  transposase IS4 family protein  34.26 
 
 		 427 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4174  transposase IS4 family protein  34.26 
 
 		 427 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1809  transposase IS4 family protein  34.26 
 
 		 427 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0317201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1805  transposase IS4 family protein  34.26 
 
 		 427 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2750  transposase IS4 family protein  34.26 
 
 		 427 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3098  transposase IS4 family protein  34.26 
 
 		 419 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0340  transposase IS4 family protein  38.1 
 
 		 455 aa  67.4  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1836  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 452 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000324968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2120  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 452 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000261492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2241  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 452 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000418169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2580  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 452 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000022544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2682  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 452 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000383398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2763  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 452 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000207771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3154  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 452 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000034185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3228  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 452 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000223138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3408  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 452 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3479  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 452 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000173185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3504  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 452 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000103535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3534  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 452 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000144429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>