More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1929 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1929  IS4 family transposase  100 
 
 		 353 aa  727    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.121993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0534  putative transposase  47.56 
 
 		 516 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1383  putative transposase or inactivated derivative  47.85 
 
 		 516 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3038  IS4 family transposase  47.85 
 
 		 516 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3052  IS4 family transposase  47.85 
 
 		 516 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0529  putative transposase  47.28 
 
 		 516 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1744  transposase IS4 family protein  44.96 
 
 		 531 aa  302  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1395  transposase IS4 family protein  45.22 
 
 		 510 aa  299  4e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0985  transposase, IS4 family protein  44.11 
 
 		 523 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810612  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8169  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7856  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0645  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8505  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7909  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0378825  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2233  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2029  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.843963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2688  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8347  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6465  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7502  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6804  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7596  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0788  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140519  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7792  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275885  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8135  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36028  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8445  transposase IS4 family protein  31.27 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4843  transposase IS4 family protein  30.9 
 
 		 444 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0683585 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7986  transposase IS4 family protein  29.11 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0308  transposase IS4 family protein  29.11 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0903  transposase IS4 family protein  29.11 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3217  transposase IS4 family protein  29.11 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8194  transposase IS4 family protein  29.11 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558489  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  31.41 
 
 		 481 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  31.09 
 
 		 481 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0982  transposase, IS4 family protein  27.86 
 
 		 441 aa  126  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.261869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  31.29 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  30.84 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  30.84 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4074  transposase IS4 family protein  28.65 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3863  transposase IS4 family protein  27.71 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  28.45 
 
 		 478 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  27.51 
 
 		 478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  28.48 
 
 		 493 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0106  transposase, IS4 family protein  25 
 
 		 452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000024097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3154  transposase, IS4 family protein  25 
 
 		 452 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000034185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  28.16 
 
 		 493 aa  110  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0019  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000185671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0526  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000180348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0861  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000191702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0874  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0896  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1013  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000243207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1107  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000102477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1108  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00911863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1128  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000155023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1649  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000032724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1836  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000324968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2120  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000261492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2241  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000418169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2580  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000022544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2682  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000383398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2763  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000207771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3228  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000223138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3479  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000173185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3504  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000103535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3534  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000144429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3601  transposase, IS4 family protein  26.17 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227766  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  32.13 
 
 		 478 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  28.99 
 
 		 486 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  28.99 
 
 		 486 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  28.99 
 
 		 486 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  28.99 
 
 		 486 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  28.99 
 
 		 486 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  28.99 
 
 		 486 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  28.99 
 
 		 486 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  28.99 
 
 		 486 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  28.99 
 
 		 486 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  28.99 
 
 		 486 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  28.99 
 
 		 486 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1480  transposase, IS4 family protein  25.9 
 
 		 452 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  28.66 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  28.66 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3408  transposase, IS4 family protein  24.72 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103338  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  31.75 
 
 		 482 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  30.79 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  30.79 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2634  transposase, IS4 family protein  25.75 
 
 		 509 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1496  transposase IS4 family protein  26.42 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000517789  hitchhiker  0.0000000823353 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1169  transposase IS4 family protein  26.7 
 
 		 445 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000912267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0625  transposase IS4 family protein  26.42 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000035382  unclonable  0.0000000000654827 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  29.72 
 
 		 479 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  29.72 
 
 		 479 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1571  transposase IS4 family protein  27.19 
 
 		 513 aa  99  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0160489  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0269  transposase, IS4  25.48 
 
 		 536 aa  97.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.464686  normal  0.0269922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0350  transposase, IS4  25.48 
 
 		 536 aa  97.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0628  transposase, IS4  25.48 
 
 		 536 aa  97.8  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378407  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1749  transposase, IS4  25.48 
 
 		 536 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.269011  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2025  transposase, IS4  25.48 
 
 		 536 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.469241  normal  0.684714 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2643  transposase, IS4  25.48 
 
 		 536 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2792  transposase  26.69 
 
 		 545 aa  97.4  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.120624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>