154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4867 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4867  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  58.51 
 
 		 482 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  56.38 
 
 		 478 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3726  transposase, IS4 family protein  58.95 
 
 		 390 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  57.45 
 
 		 493 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  57.45 
 
 		 493 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  56.38 
 
 		 478 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  54.26 
 
 		 481 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1199  transposase, IS4  54.26 
 
 		 334 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  53.19 
 
 		 481 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2404  hypothetical protein  56.84 
 
 		 251 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  53.19 
 
 		 481 aa  103  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  53.19 
 
 		 481 aa  103  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  51.61 
 
 		 477 aa  101  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  49.48 
 
 		 473 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  53.19 
 
 		 472 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  53.19 
 
 		 472 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2433  transposase, IS4  53.19 
 
 		 150 aa  100  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119357  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0759  putative transposase  50 
 
 		 195 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  53.19 
 
 		 486 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  53.19 
 
 		 486 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  53.19 
 
 		 486 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  53.19 
 
 		 486 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  53.19 
 
 		 486 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  53.19 
 
 		 486 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  53.19 
 
 		 486 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  53.19 
 
 		 486 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  53.19 
 
 		 486 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  53.19 
 
 		 486 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  53.19 
 
 		 486 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  54.26 
 
 		 472 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  52.13 
 
 		 486 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  52.13 
 
 		 486 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0139  ISPsy6 transposase  53.33 
 
 		 94 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  58.51 
 
 		 478 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  62.77 
 
 		 479 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  62.77 
 
 		 479 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  56.38 
 
 		 497 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  56.38 
 
 		 497 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  54.74 
 
 		 499 aa  80.5  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  53.19 
 
 		 482 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1169  transposase IS4 family protein  31.63 
 
 		 445 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000912267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0625  transposase IS4 family protein  31.63 
 
 		 445 aa  57.4  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000035382  unclonable  0.0000000000654827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1496  transposase IS4 family protein  31.63 
 
 		 445 aa  57  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000517789  hitchhiker  0.0000000823353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2458  IS4 family transposase  34.15 
 
 		 517 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000853603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2634  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 509 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0443  transposase  37.18 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1616  transposase IS1182 family protein  38.64 
 
 		 427 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.452366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1776  transposase IS1182 family protein  38.64 
 
 		 427 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1112  transposase IS1182 family protein  38.64 
 
 		 427 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.382376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2937  transposase IS1182 family protein  38.64 
 
 		 427 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4390  transposase IS1182 family protein  38.64 
 
 		 427 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1571  transposase IS4 family protein  37.18 
 
 		 513 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0160489  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0045  hypothetical protein  27.06 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000000482488  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3408  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0019  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000185671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0106  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000024097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0526  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000180348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0861  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000191702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0874  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0896  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1013  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000243207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1107  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000102477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1108  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00911863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1128  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000155023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1480  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1649  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000032724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1836  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000324968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2120  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000261492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2241  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000418169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2580  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000022544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2682  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000383398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2763  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000207771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3154  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000034185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3228  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000223138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3479  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000173185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3504  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000103535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3534  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000144429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3601  transposase, IS4 family protein  37.18 
 
 		 452 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1054  transposase IS1182 family protein  36.78 
 
 		 458 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0495  transposase IS1182 family protein  36.78 
 
 		 458 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324095 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0145  transposase  34.12 
 
 		 545 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0416  transposase  34.12 
 
 		 545 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.415118 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1176  transposase  34.12 
 
 		 545 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.658994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1524  transposase  34.12 
 
 		 545 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.419184  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2792  transposase  34.12 
 
 		 545 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.120624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3115  transposase  34.12 
 
 		 545 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.960078  hitchhiker  0.00180053 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1293  transposase  36.96 
 
 		 244 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3866  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 427 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3348  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 427 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3098  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 419 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3643  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 427 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0789536  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3419  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 427 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1805  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 427 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2750  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 427 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4174  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 427 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1809  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 427 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0317201  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3223  transposase, IS4 family protein  37.5 
 
 		 460 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4843  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 444 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0683585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3057  transposase IS4 family protein  36.96 
 
 		 460 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>