128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4108 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009040  Rsph17029_4108  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4289  hypothetical protein  97.77 
 
 		 242 aa  328  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3726  transposase, IS4 family protein  75.45 
 
 		 390 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2404  hypothetical protein  73.64 
 
 		 251 aa  160  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  52.48 
 
 		 493 aa  107  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  51.49 
 
 		 493 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  50.89 
 
 		 479 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  50.89 
 
 		 479 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  48.67 
 
 		 478 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  48.57 
 
 		 478 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  48.57 
 
 		 478 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  48.21 
 
 		 481 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  48.21 
 
 		 481 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  47.96 
 
 		 497 aa  99  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  47.96 
 
 		 497 aa  99  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  42.48 
 
 		 477 aa  92.8  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  49.5 
 
 		 482 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1199  transposase, IS4  44.25 
 
 		 334 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0759  putative transposase  47.52 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  45.71 
 
 		 482 aa  92.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  42.86 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  42.86 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  38.3 
 
 		 472 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  38.3 
 
 		 472 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  37.5 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  38.14 
 
 		 472 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  35.71 
 
 		 486 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  35.71 
 
 		 486 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  35.71 
 
 		 486 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  35.71 
 
 		 486 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  35.71 
 
 		 486 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  35.71 
 
 		 486 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  35.71 
 
 		 486 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  35.71 
 
 		 486 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  35.71 
 
 		 486 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  35.71 
 
 		 486 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  35.71 
 
 		 486 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  35.71 
 
 		 486 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  35.71 
 
 		 486 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  37.8 
 
 		 473 aa  65.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5780  transposase IS4 family protein  44.44 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4843  transposase IS4 family protein  34.44 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0683585 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7909  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0378825  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7856  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8135  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36028  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8169  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2688  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2233  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6804  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6465  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2029  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.843963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7596  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7502  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121497  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7792  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275885  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8347  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553537  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8505  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8445  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0645  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0788  transposase IS4 family protein  32.18 
 
 		 444 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140519  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4074  transposase IS4 family protein  30.1 
 
 		 440 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3863  transposase IS4 family protein  30.1 
 
 		 440 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1439  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 		 535 aa  51.6  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2433  transposase, IS4  53.49 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119357  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8194  transposase IS4 family protein  31.03 
 
 		 444 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558489  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7986  transposase IS4 family protein  31.03 
 
 		 444 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3217  transposase IS4 family protein  31.03 
 
 		 444 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0903  transposase IS4 family protein  31.03 
 
 		 444 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0308  transposase IS4 family protein  31.03 
 
 		 444 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0009  transposase, IS4  29.17 
 
 		 536 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.272991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0072  transposase, IS4  29.17 
 
 		 536 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.173128  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0183  transposase, IS4  29.17 
 
 		 536 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0269  transposase, IS4  29.17 
 
 		 536 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.464686  normal  0.0269922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0350  transposase, IS4  29.17 
 
 		 536 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0387  transposase, IS4  29.17 
 
 		 536 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0612523  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0412  transposase, IS4  29.17 
 
 		 536 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185935  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0439  transposase, IS4  29.17 
 
 		 536 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0484  transposase, IS4  29.17 
 
 		 536 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0590  transposase, IS4  29.17 
 
 		 536 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.366891  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0628  transposase, IS4  29.17 
 
 		 536 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378407  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0697  transposase, IS4  29.17 
 
 		 536 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.876809  normal  0.052348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1536  transposase, IS4  29.17 
 
 		 536 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1749  transposase, IS4  29.17 
 
 		 536 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.269011  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2025  transposase, IS4  29.17 
 
 		 536 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.469241  normal  0.684714 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2643  transposase, IS4  29.17 
 
 		 536 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3125  transposase, IS4  29.17 
 
 		 536 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000237223 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0273  transposase, IS4  29.17 
 
 		 516 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0241108 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1107  transposase, IS4 family protein  34.94 
 
 		 452 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000102477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0106  transposase, IS4 family protein  34.94 
 
 		 452 aa  45.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000024097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3154  transposase, IS4 family protein  34.94 
 
 		 452 aa  45.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000034185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3408  transposase, IS4 family protein  34.94 
 
 		 452 aa  45.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0019  transposase, IS4 family protein  34.94 
 
 		 452 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000185671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0526  transposase, IS4 family protein  34.94 
 
 		 452 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000180348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0861  transposase, IS4 family protein  34.94 
 
 		 452 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000191702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0874  transposase, IS4 family protein  34.94 
 
 		 452 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0896  transposase, IS4 family protein  34.94 
 
 		 452 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1013  transposase, IS4 family protein  34.94 
 
 		 452 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000243207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1108  transposase, IS4 family protein  34.94 
 
 		 452 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00911863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1128  transposase, IS4 family protein  34.94 
 
 		 452 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000155023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1480  transposase, IS4 family protein  34.94 
 
 		 452 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1649  transposase, IS4 family protein  34.94 
 
 		 452 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000032724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>