145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4651 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  912    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  59.82 
 
 
517 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  59.82 
 
 
517 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  59.82 
 
 
517 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  59.82 
 
 
517 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  60.04 
 
 
517 aa  490  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  59.82 
 
 
517 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  59.82 
 
 
517 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  59.82 
 
 
517 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  59.6 
 
 
517 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  59.6 
 
 
517 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  60.13 
 
 
515 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  59.73 
 
 
515 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  59.73 
 
 
515 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  59.73 
 
 
515 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  59.6 
 
 
517 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  59.4 
 
 
515 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  59.4 
 
 
515 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  59.4 
 
 
515 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  59.4 
 
 
515 aa  477  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  59.17 
 
 
515 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  45.6 
 
 
508 aa  341  2e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  45.37 
 
 
508 aa  340  4e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  45.37 
 
 
508 aa  340  4e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  45.37 
 
 
508 aa  340  4e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  45.37 
 
 
508 aa  340  4e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  45.37 
 
 
508 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  45.14 
 
 
508 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  29.49 
 
 
518 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  29.49 
 
 
518 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  30.46 
 
 
576 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  27.19 
 
 
553 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  27.19 
 
 
553 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  27.19 
 
 
553 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  27.19 
 
 
553 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  27.19 
 
 
553 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  27.07 
 
 
585 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  27.07 
 
 
585 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  27.07 
 
 
585 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  27.07 
 
 
585 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  27.07 
 
 
585 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  27.15 
 
 
558 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  27.15 
 
 
558 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  26.51 
 
 
559 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  21.72 
 
 
559 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  21.77 
 
 
594 aa  70.1  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  24.74 
 
 
566 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  24.74 
 
 
566 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  24.74 
 
 
566 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  24.66 
 
 
554 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  22.02 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  22.02 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  22.02 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  22.02 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  22.02 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  22.02 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  22.02 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  22.02 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  22.02 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  22.02 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  22.02 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  22.02 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  22.02 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  27.64 
 
 
680 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2451  hypothetical protein  23.53 
 
 
513 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  22.54 
 
 
406 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1873  transposase, IS4  34.01 
 
 
213 aa  63.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4420  hypothetical protein  24.23 
 
 
575 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187576  normal  0.765326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  38.05 
 
 
559 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  23.08 
 
 
511 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0101  hypothetical protein  41.03 
 
 
454 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0153  transposase IS4 family protein  23.92 
 
 
557 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000196095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0575  transposase IS4 family protein  23.92 
 
 
547 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000022159  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  27.82 
 
 
442 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2968  hypothetical protein  30.6 
 
 
272 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  25.91 
 
 
502 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1875  transposase  33.01 
 
 
360 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.590508 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  21.31 
 
 
551 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  21.31 
 
 
569 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  21.31 
 
 
551 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0420  hypothetical protein  31.78 
 
 
246 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  31.05 
 
 
478 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  33.12 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1876  putative transposase  26.1 
 
 
305 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1005  transposase IS4 family protein  23.68 
 
 
557 aa  53.1  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000370054  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5660  transposase IS4 family protein  36.84 
 
 
365 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633118  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0233  transposase  32.58 
 
 
97 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  29.06 
 
 
440 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  29.06 
 
 
440 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  29.06 
 
 
440 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  29.06 
 
 
440 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  29.06 
 
 
440 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  29.06 
 
 
440 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0495  transposase IS1182 family protein  33.56 
 
 
458 aa  50.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324095 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1054  transposase IS1182 family protein  33.56 
 
 
458 aa  50.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61591  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  30.7 
 
 
426 aa  50.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  29.19 
 
 
477 aa  49.7  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  28.8 
 
 
440 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2866  transposase, IS4 family protein  32.67 
 
 
362 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.953499  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3184  transposase, IS4 family protein  32.67 
 
 
362 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>