More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2451 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2451  hypothetical protein  100 
 
 
513 aa  1060    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1656  transposase IS4 family protein  30 
 
 
486 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.129974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2221  ISBma2, transposase  24.27 
 
 
545 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0858629  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1138  ISBma2, transposase  24.27 
 
 
534 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1402  ISBma2, transposase  24.27 
 
 
543 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2829  ISBma2, transposase  24.27 
 
 
533 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1274  ISBma2, transposase  24.27 
 
 
607 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3308  ISBma2, transposase  24.27 
 
 
607 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.204103  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2002  ISBma2, transposase  24.27 
 
 
607 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2335  ISBma2, transposase  24.27 
 
 
541 aa  140  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0367597  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1172  hypothetical protein  26.69 
 
 
462 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0849908 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0960  hypothetical protein  26.88 
 
 
461 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1178  hypothetical protein  26.88 
 
 
512 aa  139  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.216502 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0153  transposase IS4 family protein  24.38 
 
 
557 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000196095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0575  transposase IS4 family protein  24.42 
 
 
547 aa  135  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000022159  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  25.9 
 
 
457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  25.9 
 
 
457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  25.9 
 
 
457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  25.9 
 
 
457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5003  transposase IS4 family protein  24.95 
 
 
468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.600524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2964  transposase IS4 family protein  24.95 
 
 
468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1005  transposase IS4 family protein  24.52 
 
 
557 aa  130  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000370054  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1054  transposase IS1182 family protein  24.44 
 
 
458 aa  118  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61591  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0495  transposase IS1182 family protein  24.44 
 
 
458 aa  118  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324095 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3223  transposase, IS4 family protein  24.9 
 
 
460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.379638  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0328  transposase IS4 family protein  25.6 
 
 
450 aa  116  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2276  transposase IS4 family protein  25.6 
 
 
450 aa  116  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2267  transposase IS4 family protein  25.6 
 
 
450 aa  116  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3682  transposase IS4 family protein  24.17 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399219  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3878  transposase IS4 family protein  24.17 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.726843 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4079  transposase IS4 family protein  24.17 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0888192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  23.98 
 
 
458 aa  114  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0846  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2570  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
516 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.647466  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2033  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
497 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2779  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
537 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2643  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
523 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3029  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
493 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2896  transposase  35.92 
 
 
348 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0203  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
516 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2098  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
497 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579846  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2516  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
522 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.573756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3220  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
514 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1600  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
515 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0017  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
497 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0757  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
577 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0917  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
497 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304514  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1722  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
580 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0051  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0082  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0168  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0381  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.653097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0388  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0426  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111451  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0488  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0728  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0457803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1739  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1742  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0432719  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2227  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2278  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000228455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2340  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2362  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2418  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.692381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2563  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2753  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2790  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0388897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2803  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2912  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.199238  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2982  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3139  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0516599  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3182  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3216  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.450921  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3239  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3291  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3361  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0170  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0332  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0872  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0307509  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0878  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941052  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1121  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1506  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1804  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0335  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
493 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2607  transposase  35.92 
 
 
493 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0639389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0251  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
514 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0681  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
541 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2998  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
515 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0108  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
493 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.745289  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2087  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
493 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0444766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3562  transposase  35.92 
 
 
493 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2953  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.67663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3337  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3200  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
514 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4459  putative transposase  35.66 
 
 
497 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.578648 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2096  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
522 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2189  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
518 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0782  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
493 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0123  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
487 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00838697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2294  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
509 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.104034  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2518  ISBma2, transposase  35.92 
 
 
539 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>