180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2204 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  74.76 
 
 
515 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  74.76 
 
 
515 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  74.76 
 
 
515 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  74.76 
 
 
515 aa  753    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  73.59 
 
 
517 aa  743    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  73.79 
 
 
517 aa  745    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  73.79 
 
 
517 aa  745    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  73.59 
 
 
517 aa  742    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  73.79 
 
 
517 aa  745    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  73.79 
 
 
517 aa  745    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  73.59 
 
 
517 aa  744    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  73.79 
 
 
517 aa  745    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  73.79 
 
 
517 aa  745    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  73.59 
 
 
517 aa  742    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  73.79 
 
 
517 aa  745    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  86.77 
 
 
515 aa  879    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
515 aa  1038    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
515 aa  1038    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
515 aa  1038    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  74.56 
 
 
515 aa  752    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  58.84 
 
 
453 aa  497  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  47.41 
 
 
508 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  47.3 
 
 
508 aa  413  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  47.1 
 
 
508 aa  411  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  47.1 
 
 
508 aa  410  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  47.1 
 
 
508 aa  411  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  47.1 
 
 
508 aa  411  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  47.1 
 
 
508 aa  411  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  30.02 
 
 
518 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  30.02 
 
 
518 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  31.99 
 
 
576 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4652  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  58.97 
 
 
500 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.801601  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  29.01 
 
 
553 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  29.01 
 
 
553 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  29.01 
 
 
553 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  29.01 
 
 
553 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  29.01 
 
 
553 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  25.75 
 
 
558 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  25.75 
 
 
558 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  26.8 
 
 
566 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  26.8 
 
 
566 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  26.8 
 
 
566 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  26.81 
 
 
559 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  28.46 
 
 
554 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  25.67 
 
 
511 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3468  hypothetical protein  74 
 
 
106 aa  74.3  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.664267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  27.18 
 
 
680 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  23.92 
 
 
551 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  23.92 
 
 
551 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  23.92 
 
 
569 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1876  putative transposase  28.32 
 
 
305 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0101  hypothetical protein  37.5 
 
 
454 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  22.63 
 
 
522 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  22.63 
 
 
522 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  22.63 
 
 
522 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  22.63 
 
 
522 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  22.63 
 
 
522 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  22.63 
 
 
522 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  22.63 
 
 
522 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  22.63 
 
 
522 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  22.63 
 
 
522 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  22.63 
 
 
522 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  22.63 
 
 
522 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  22.63 
 
 
522 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  22.63 
 
 
522 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  22.63 
 
 
559 aa  63.9  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  22.63 
 
 
594 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4420  hypothetical protein  24.29 
 
 
575 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187576  normal  0.765326 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0420  hypothetical protein  31.82 
 
 
246 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  36.04 
 
 
559 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2451  hypothetical protein  21.3 
 
 
513 aa  57.4  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  22.05 
 
 
406 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1873  transposase, IS4  30.88 
 
 
213 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  25.63 
 
 
442 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  29.61 
 
 
472 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  29.61 
 
 
472 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
585 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
585 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
585 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
585 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  30.88 
 
 
585 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5548  hypothetical protein  27.05 
 
 
490 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  28 
 
 
478 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2968  hypothetical protein  27.93 
 
 
272 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  30.77 
 
 
479 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  30.38 
 
 
352 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  30.77 
 
 
479 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4013  transposase IS4 family protein  26.48 
 
 
483 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0559  ISGsu2, transposase  26.83 
 
 
361 aa  51.6  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1297  ISGsu2, transposase  26.83 
 
 
361 aa  51.6  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2597  ISGsu2, transposase  26.83 
 
 
361 aa  51.6  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  26.85 
 
 
458 aa  50.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  26.39 
 
 
502 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1875  transposase  29.66 
 
 
360 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.590508 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5660  transposase IS4 family protein  31.76 
 
 
365 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633118  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0686  transposase IS4 family protein  32.54 
 
 
362 aa  49.3  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.278758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2015  transposase IS4 family protein  32.54 
 
 
362 aa  49.3  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1337  transposase IS4 family protein  32.54 
 
 
362 aa  49.3  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2156  IS5 family transposase  31.43 
 
 
260 aa  49.3  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0340068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3703  transposase, IS4 family protein  32.54 
 
 
362 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.757011  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>