22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3468 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3468  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  207  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.664267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  74 
 
 		 515 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  74 
 
 		 515 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  74 
 
 		 515 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4652  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  64.29 
 
 		 500 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.801601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  68.63 
 
 		 517 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  68.63 
 
 		 517 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  68.63 
 
 		 517 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  68.63 
 
 		 517 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  68.63 
 
 		 517 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  68.63 
 
 		 517 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  68.63 
 
 		 517 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  68.63 
 
 		 517 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  68.63 
 
 		 517 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  68.63 
 
 		 517 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  68.63 
 
 		 517 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  69.39 
 
 		 515 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  75 
 
 		 515 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  69.39 
 
 		 515 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  69.39 
 
 		 515 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  69.39 
 
 		 515 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  69.39 
 
 		 515 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>