95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4013 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  79.79 
 
 
554 aa  716    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5548  hypothetical protein  95.45 
 
 
490 aa  907    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4013  transposase IS4 family protein  100 
 
 
483 aa  977    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  87.12 
 
 
442 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  43.89 
 
 
551 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  43.89 
 
 
551 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  43.89 
 
 
569 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  44.98 
 
 
522 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  44.98 
 
 
522 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  44.98 
 
 
522 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  44.98 
 
 
522 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  44.98 
 
 
522 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  44.98 
 
 
522 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  44.98 
 
 
522 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  44.98 
 
 
522 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  44.98 
 
 
522 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  44.98 
 
 
522 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  44.98 
 
 
522 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  44.98 
 
 
522 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  44.98 
 
 
522 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  44.98 
 
 
559 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  44.98 
 
 
594 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  43.98 
 
 
566 aa  360  3e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  43.98 
 
 
566 aa  360  3e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  43.98 
 
 
566 aa  360  3e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  46.28 
 
 
502 aa  360  5e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  46.1 
 
 
553 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  46.1 
 
 
553 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  46.1 
 
 
553 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  46.1 
 
 
553 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  46.1 
 
 
553 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0234  transposase IS4  44.52 
 
 
424 aa  340  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  43.67 
 
 
559 aa  335  7.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  44.59 
 
 
558 aa  335  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  44.59 
 
 
558 aa  335  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  43.8 
 
 
559 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  45.66 
 
 
406 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  38.93 
 
 
511 aa  288  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  41.31 
 
 
680 aa  285  9e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 
585 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 
585 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 
585 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 
585 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 
585 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  47.66 
 
 
352 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2969  transposase  43.26 
 
 
223 aa  173  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2968  hypothetical protein  46.8 
 
 
272 aa  166  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1874  hypothetical protein  37.38 
 
 
229 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1875  transposase  37.62 
 
 
360 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.590508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  27.56 
 
 
517 aa  70.1  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  27.56 
 
 
517 aa  70.1  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  27.33 
 
 
517 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  27.33 
 
 
517 aa  67  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  27.33 
 
 
517 aa  67  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  27.33 
 
 
517 aa  67  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  27.33 
 
 
517 aa  67  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  27.33 
 
 
517 aa  67  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  27.33 
 
 
517 aa  67  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  27.33 
 
 
517 aa  67  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  27.33 
 
 
517 aa  67  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  26.75 
 
 
515 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  26.75 
 
 
515 aa  57  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  26.75 
 
 
515 aa  57  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  26.75 
 
 
515 aa  57  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  26.75 
 
 
515 aa  57  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  26.48 
 
 
515 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  26.48 
 
 
515 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  26.48 
 
 
515 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  26.12 
 
 
458 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 
508 aa  51.2  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 
508 aa  51.2  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 
508 aa  51.2  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1873  transposase, IS4  31.15 
 
 
213 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 
508 aa  51.2  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 
508 aa  51.2  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 
508 aa  51.2  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  24.79 
 
 
576 aa  50.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  23.94 
 
 
518 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  23.94 
 
 
518 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4420  hypothetical protein  23.45 
 
 
575 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187576  normal  0.765326 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1054  transposase IS1182 family protein  26.81 
 
 
458 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61591  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0495  transposase IS1182 family protein  26.81 
 
 
458 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324095 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  26.19 
 
 
508 aa  47.8  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5003  transposase IS4 family protein  29.12 
 
 
468 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.600524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2964  transposase IS4 family protein  29.12 
 
 
468 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2451  hypothetical protein  29.59 
 
 
513 aa  44.3  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0718  hypothetical protein  20.81 
 
 
515 aa  43.9  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2276  transposase IS4 family protein  26.44 
 
 
450 aa  43.5  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2267  transposase IS4 family protein  26.44 
 
 
450 aa  43.5  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0328  transposase IS4 family protein  26.44 
 
 
450 aa  43.5  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0290  hypothetical protein  20.81 
 
 
548 aa  43.5  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0216247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0310  hypothetical protein  20.81 
 
 
548 aa  43.5  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1592  hypothetical protein  20.81 
 
 
548 aa  43.5  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1757  hypothetical protein  20.81 
 
 
548 aa  43.5  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0514  hypothetical protein  20.81 
 
 
548 aa  43.5  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>