266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0514 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0290  hypothetical protein  100 
 
 		 548 aa  1142    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0216247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0310  hypothetical protein  100 
 
 		 548 aa  1142    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0514  hypothetical protein  100 
 
 		 548 aa  1142    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0718  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1071    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1592  hypothetical protein  100 
 
 		 548 aa  1142    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1757  hypothetical protein  100 
 
 		 548 aa  1142    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4420  hypothetical protein  29.85 
 
 		 575 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187576  normal  0.765326 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  21.91 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  22.16 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  21.8 
 
 		 508 aa  75.5  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  22.16 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  22.16 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  22.16 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  22.16 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  22.77 
 
 		 551 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  25.14 
 
 		 478 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  22.77 
 
 		 551 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  22.97 
 
 		 569 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  23.08 
 
 		 518 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  23.08 
 
 		 518 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  21.48 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  21.48 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  21.48 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  21.48 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  21.48 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  21.48 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  21.48 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  21.48 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  21.48 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  21.48 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  21.48 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  21.48 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  21.48 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  21.48 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  24.29 
 
 		 553 aa  62  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  24.29 
 
 		 553 aa  62  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  24.29 
 
 		 553 aa  62  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  24.29 
 
 		 553 aa  62  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  21.48 
 
 		 559 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  24.29 
 
 		 553 aa  62  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  20.98 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  23.23 
 
 		 558 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  20.98 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  23.23 
 
 		 558 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  20.98 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2451  hypothetical protein  23.49 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  38.16 
 
 		 442 aa  57  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  23.65 
 
 		 511 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  22.01 
 
 		 559 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  35.06 
 
 		 460 aa  54.7  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  19.41 
 
 		 515 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  24.58 
 
 		 502 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  19.65 
 
 		 585 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  19.65 
 
 		 585 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  22.7 
 
 		 680 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  19.65 
 
 		 585 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  19.65 
 
 		 585 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  19.65 
 
 		 585 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  19.22 
 
 		 515 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  19.22 
 
 		 515 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  19.22 
 
 		 515 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  19.22 
 
 		 515 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  34.25 
 
 		 435 aa  50.1  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0792  transposase, IS4 family protein  20.54 
 
 		 577 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0234  transposase IS4  22.85 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  19.21 
 
 		 473 aa  47  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5548  hypothetical protein  21.26 
 
 		 490 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  27.13 
 
 		 412 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1178  hypothetical protein  21.72 
 
 		 512 aa  46.2  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.216502 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1172  hypothetical protein  21.72 
 
 		 462 aa  45.8  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0849908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  21.62 
 
 		 406 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2300  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.23481  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2396  transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3070  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 524 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.737169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1480  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2516  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 522 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.573756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1524  transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2064  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1585  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 487 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172447  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1974  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1630  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3093  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0166963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2581  putative transposase  21.19 
 
 		 497 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1994  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 509 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.552518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3225  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3391  transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2903  transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3139  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 487 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0516599  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1438  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.86843  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3096  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2522  transposase  21.19 
 
 		 497 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.981989  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2975  transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1585  transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0335  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0484  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0573  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127326  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2087  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0444766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2224  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2227  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2248  ISBma2, transposase  21.19 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>