163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7278 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7278  transposase  100 
 
 		 412 aa  844    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  72.73 
 
 		 451 aa  599  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  72.77 
 
 		 448 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  72.77 
 
 		 448 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  72.77 
 
 		 448 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  64.11 
 
 		 448 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  49.75 
 
 		 442 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  46.88 
 
 		 442 aa  353  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  42.72 
 
 		 451 aa  342  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  45.93 
 
 		 440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  45.93 
 
 		 440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  45.93 
 
 		 440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  45.93 
 
 		 440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  45.93 
 
 		 440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  45.93 
 
 		 440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  44.09 
 
 		 448 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  43.28 
 
 		 448 aa  329  6e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  44.83 
 
 		 440 aa  329  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  45.69 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  46.52 
 
 		 486 aa  322  7e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  44.92 
 
 		 426 aa  322  9.000000000000001e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  44.92 
 
 		 426 aa  322  9.000000000000001e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3125  transposase, IS4 family protein  53.11 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  45.61 
 
 		 458 aa  319  5e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  45.37 
 
 		 486 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  44.88 
 
 		 486 aa  312  7.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  44.63 
 
 		 472 aa  311  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  44.39 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  42.53 
 
 		 415 aa  299  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  42.36 
 
 		 460 aa  297  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  43.63 
 
 		 491 aa  296  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  43.63 
 
 		 491 aa  296  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1447  hypothetical protein  56.51 
 
 		 323 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.551503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  45.58 
 
 		 423 aa  287  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  46.58 
 
 		 495 aa  283  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  46.58 
 
 		 495 aa  283  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  46.58 
 
 		 495 aa  283  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  46.58 
 
 		 495 aa  283  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  46.58 
 
 		 495 aa  283  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  43.89 
 
 		 374 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  43.15 
 
 		 491 aa  276  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  43.15 
 
 		 491 aa  276  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  43.4 
 
 		 491 aa  275  7e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  43.65 
 
 		 491 aa  275  8e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  43.4 
 
 		 491 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  43 
 
 		 529 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02569  transposase  46.53 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01571  transposase  47.13 
 
 		 362 aa  262  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  41.08 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  42.23 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  42.23 
 
 		 408 aa  256  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02101  transposase  47.89 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0799  transposase, IS4 family protein  45.33 
 
 		 313 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00319  transposase  43.89 
 
 		 390 aa  229  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  36.99 
 
 		 435 aa  227  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03351  putative ISXoo5 transposase  45.99 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  44.98 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3211  hypothetical protein  49.32 
 
 		 280 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375208  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04446  tRNA nucleotidyltransferase  52.97 
 
 		 713 aa  206  6e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0105255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03599  transposase  53.61 
 
 		 259 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03660  transposase  53.09 
 
 		 259 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03204  transposase  53.09 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04816  transposase  46.98 
 
 		 306 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00639  transposase  53.09 
 
 		 259 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01423  transposase  52.58 
 
 		 259 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01806  transposase  42.22 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05578  IS1478 transposase  52.58 
 
 		 259 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03221  transposase  52.58 
 
 		 259 aa  193  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03921  transposase  52.55 
 
 		 261 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00613  transposase  52.55 
 
 		 261 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03512  transposase  52.55 
 
 		 261 aa  189  8e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02774  transposase  51.37 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03646  transposase  51.37 
 
 		 267 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4203  transposase, IS4  48 
 
 		 231 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3213  transposase, IS4 family protein  58.9 
 
 		 181 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03939  transposase  51.43 
 
 		 268 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.796315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00902  transposase  53.42 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00478777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01804  ISXoo5 transposase  42.54 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03291  transposase  52.17 
 
 		 230 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06260  ISXoo5 transposase  41.7 
 
 		 296 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0310344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01098  ISXoo5 transposase  41.7 
 
 		 296 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0546611  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4246  hypothetical protein  39.05 
 
 		 270 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02164  transposase  41.91 
 
 		 266 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00714  transposase  43.79 
 
 		 231 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00306145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02561  transposase (IS4 family)  42.2 
 
 		 196 aa  127  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0316  hypothetical protein  47.48 
 
 		 168 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.957469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03521  transposase  52.71 
 
 		 130 aa  123  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02255  transposase  50 
 
 		 186 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01849  transposase  41.42 
 
 		 241 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00299  transposase (IS4 family)  40 
 
 		 180 aa  110  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129029  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0798  hypothetical protein  43.22 
 
 		 166 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01957  transposase (IS4 family)  40.62 
 
 		 180 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02554  transposase  54.17 
 
 		 162 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0840457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02558  transposase  53.77 
 
 		 147 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254439  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1921  transposase, IS5 family, putative  29.34 
 
 		 498 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1382  transposase, IS5 family, putative  29.06 
 
 		 498 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0494  transposase, IS5 family, putative  29.06 
 
 		 498 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0722  transposase, IS5 family, putative  29.06 
 
 		 498 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000096619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0664  transposase, IS5 family, putative  29.06 
 
 		 498 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1432  transposase, IS5 family, putative  29.06 
 
 		 498 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>