147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0494 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1921  transposase, IS5 family, putative  93.17 
 
 
498 aa  956    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1432  transposase, IS5 family, putative  100 
 
 
498 aa  1026    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1382  transposase, IS5 family, putative  100 
 
 
498 aa  1026    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0722  transposase, IS5 family, putative  100 
 
 
498 aa  1026    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000096619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0494  transposase, IS5 family, putative  100 
 
 
498 aa  1026    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0664  transposase, IS5 family, putative  100 
 
 
498 aa  1026    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2434  transposase, IS5 family, putative  100 
 
 
498 aa  1026    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4299  transposase  51.08 
 
 
508 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4186  hypothetical protein  45.03 
 
 
509 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4524  ISPg7, transposase  59.35 
 
 
148 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  25.66 
 
 
442 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  27.1 
 
 
451 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  27.09 
 
 
438 aa  107  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  28.83 
 
 
440 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  28.83 
 
 
440 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  28.83 
 
 
440 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  28.83 
 
 
440 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  28.83 
 
 
440 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  28.83 
 
 
440 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  25.6 
 
 
448 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  24.63 
 
 
460 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  28.5 
 
 
426 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  26.48 
 
 
442 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  29.6 
 
 
412 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  29.97 
 
 
448 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  29.97 
 
 
448 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  29.97 
 
 
448 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  24.84 
 
 
451 aa  99.8  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  25.83 
 
 
448 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  28.23 
 
 
440 aa  97.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  26.9 
 
 
472 aa  92.8  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  27.79 
 
 
426 aa  92.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  27.79 
 
 
426 aa  92.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  27.76 
 
 
423 aa  92  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  26.54 
 
 
435 aa  91.3  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  27.68 
 
 
458 aa  89.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  28.11 
 
 
448 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  25.95 
 
 
486 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  29.62 
 
 
486 aa  87.8  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  25.63 
 
 
486 aa  87.8  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  26.9 
 
 
491 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  26.9 
 
 
491 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  25.37 
 
 
477 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02101  transposase  28.16 
 
 
344 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02569  transposase  26.87 
 
 
388 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01571  transposase  26.57 
 
 
362 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  27.99 
 
 
287 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01423  transposase  30.71 
 
 
259 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03221  transposase  32.6 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0695  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.31 
 
 
464 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.776838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1807  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.31 
 
 
464 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1808  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.31 
 
 
464 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1809  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.31 
 
 
464 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239989  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03939  transposase  33.14 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.796315  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4203  transposase, IS4  25.85 
 
 
231 aa  79  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00639  transposase  30 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04446  tRNA nucleotidyltransferase  31.34 
 
 
713 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0105255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03660  transposase  29.46 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00902  transposase  31.98 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00478777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05578  IS1478 transposase  33.15 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03204  transposase  29.46 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03599  transposase  30.4 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03921  transposase  33.14 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00613  transposase  32.46 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03646  transposase  31.98 
 
 
267 aa  77  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0045  hypothetical protein  66.1 
 
 
87 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3211  hypothetical protein  26.98 
 
 
280 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375208  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02774  transposase  32.18 
 
 
302 aa  76.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03512  transposase  32.97 
 
 
261 aa  76.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  27.37 
 
 
415 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03291  transposase  32.56 
 
 
230 aa  75.5  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4246  hypothetical protein  32.74 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04816  transposase  29.34 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  23.88 
 
 
491 aa  73.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  23.88 
 
 
491 aa  72.8  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  23.88 
 
 
491 aa  72.8  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  23.88 
 
 
529 aa  71.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00319  transposase  24.3 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03351  putative ISXoo5 transposase  24.63 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02554  transposase  35.71 
 
 
162 aa  67  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0840457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02255  transposase  36.45 
 
 
186 aa  66.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  22.95 
 
 
491 aa  64.3  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  28.13 
 
 
374 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  22.95 
 
 
491 aa  64.3  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0798  hypothetical protein  35.79 
 
 
166 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03992  transposase  36.36 
 
 
151 aa  62.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02629  transposase  36.36 
 
 
151 aa  61.6  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0812  hypothetical protein  33.66 
 
 
153 aa  61.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  25.42 
 
 
495 aa  60.5  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  25.42 
 
 
495 aa  60.5  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  25.42 
 
 
495 aa  60.5  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  25.42 
 
 
495 aa  60.5  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  25.42 
 
 
495 aa  60.5  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  24.35 
 
 
408 aa  58.2  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2155  transposase IS4  26.9 
 
 
174 aa  54.7  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0585469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13421  transposase  25 
 
 
225 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.43078e-16  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  24.14 
 
 
408 aa  54.3  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1219  transposase IS4 family protein  22.22 
 
 
450 aa  53.5  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1384  transposase IS4 family protein  22.22 
 
 
450 aa  53.5  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1826  transposase IS4 family protein  22.22 
 
 
450 aa  53.5  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>