177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1771 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  100 
 
 		 448 aa  915    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  61.14 
 
 		 448 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  61.14 
 
 		 448 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  61.14 
 
 		 448 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  60.39 
 
 		 451 aa  529  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  65.19 
 
 		 412 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  48.22 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  46.39 
 
 		 440 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  47.19 
 
 		 442 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  44.75 
 
 		 448 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  46.5 
 
 		 440 aa  362  8e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  46.5 
 
 		 440 aa  362  8e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  46.5 
 
 		 440 aa  362  8e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  46.5 
 
 		 440 aa  362  8e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  46.5 
 
 		 440 aa  362  8e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  46.5 
 
 		 440 aa  362  8e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  45.54 
 
 		 426 aa  359  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  45.54 
 
 		 426 aa  359  5e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  44.75 
 
 		 448 aa  356  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  44.81 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  44 
 
 		 451 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  47.51 
 
 		 458 aa  349  5e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  47.74 
 
 		 486 aa  346  4e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  46.62 
 
 		 486 aa  340  2e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  46.56 
 
 		 486 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  45.92 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  45.84 
 
 		 477 aa  334  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  42.08 
 
 		 415 aa  328  9e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  45.65 
 
 		 491 aa  323  4e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  45.65 
 
 		 491 aa  323  4e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  42.56 
 
 		 460 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  46.51 
 
 		 423 aa  307  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3125  transposase, IS4 family protein  51.71 
 
 		 360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  41.38 
 
 		 491 aa  290  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  40.95 
 
 		 491 aa  289  7e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  41.16 
 
 		 491 aa  289  9e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02569  transposase  47.55 
 
 		 388 aa  288  9e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  41.98 
 
 		 495 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  41.98 
 
 		 495 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  41.98 
 
 		 495 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  41.98 
 
 		 495 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  41.98 
 
 		 495 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  41.29 
 
 		 491 aa  286  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  41.29 
 
 		 491 aa  286  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  40.95 
 
 		 529 aa  283  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01571  transposase  50 
 
 		 362 aa  283  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1447  hypothetical protein  56.03 
 
 		 323 aa  282  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.551503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  43.02 
 
 		 374 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  39.91 
 
 		 438 aa  275  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02101  transposase  48.7 
 
 		 344 aa  269  8.999999999999999e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  43.12 
 
 		 408 aa  263  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  42.97 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  47.89 
 
 		 287 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  36.41 
 
 		 435 aa  249  5e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3211  hypothetical protein  49.22 
 
 		 280 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375208  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00319  transposase  40.27 
 
 		 390 aa  232  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04446  tRNA nucleotidyltransferase  53.1 
 
 		 713 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0105255  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0799  transposase, IS4 family protein  44.83 
 
 		 313 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04816  transposase  47.86 
 
 		 306 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00639  transposase  54.13 
 
 		 259 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03599  transposase  54.13 
 
 		 259 aa  223  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03351  putative ISXoo5 transposase  41.33 
 
 		 415 aa  217  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03204  transposase  52.75 
 
 		 259 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03660  transposase  52.29 
 
 		 259 aa  216  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05578  IS1478 transposase  52.75 
 
 		 259 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03221  transposase  53.21 
 
 		 259 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03512  transposase  54.09 
 
 		 261 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01806  transposase  44.52 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00613  transposase  53.18 
 
 		 261 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03921  transposase  53.18 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01423  transposase  51.83 
 
 		 259 aa  212  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02774  transposase  52.17 
 
 		 302 aa  199  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03646  transposase  52.17 
 
 		 267 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4203  transposase, IS4  46.41 
 
 		 231 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00902  transposase  55.74 
 
 		 288 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00478777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03939  transposase  52.76 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.796315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03291  transposase  55.19 
 
 		 230 aa  190  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4246  hypothetical protein  46.77 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01804  ISXoo5 transposase  44.81 
 
 		 296 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06260  ISXoo5 transposase  43.7 
 
 		 296 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0310344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01098  ISXoo5 transposase  43.7 
 
 		 296 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0546611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02164  transposase  44.12 
 
 		 266 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3213  transposase, IS4 family protein  54.48 
 
 		 181 aa  155  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0798  hypothetical protein  45.39 
 
 		 166 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02255  transposase  51.11 
 
 		 186 aa  132  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00714  transposase  42.03 
 
 		 231 aa  131  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00306145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03521  transposase  53.08 
 
 		 130 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02561  transposase (IS4 family)  44.44 
 
 		 196 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02554  transposase  55.83 
 
 		 162 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0840457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02629  transposase  55.45 
 
 		 151 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03992  transposase  54.55 
 
 		 151 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01849  transposase  39.22 
 
 		 241 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0316  hypothetical protein  43.8 
 
 		 168 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.957469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1921  transposase, IS5 family, putative  27.25 
 
 		 498 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02654  transposase  53.33 
 
 		 189 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3127  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00299  transposase (IS4 family)  41.14 
 
 		 180 aa  103  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129029  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01957  transposase (IS4 family)  39.87 
 
 		 180 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0494  transposase, IS5 family, putative  28.11 
 
 		 498 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0722  transposase, IS5 family, putative  28.11 
 
 		 498 aa  99.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000096619 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>