119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3125 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3125  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
360 aa  725    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343643  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  52.62 
 
 
448 aa  345  8e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  52.62 
 
 
448 aa  345  8e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  52.62 
 
 
448 aa  345  8e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  52.32 
 
 
451 aa  339  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  54.68 
 
 
442 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  52.94 
 
 
412 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  52.06 
 
 
448 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  47.49 
 
 
440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3213  transposase, IS4 family protein  92.49 
 
 
181 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  47.97 
 
 
374 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  47.84 
 
 
440 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  47.84 
 
 
440 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  47.84 
 
 
440 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  47.84 
 
 
440 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  47.84 
 
 
440 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  47.84 
 
 
440 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1447  hypothetical protein  57.65 
 
 
323 aa  297  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.551503  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  46.41 
 
 
448 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  45.3 
 
 
448 aa  289  6e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  46.22 
 
 
426 aa  279  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3211  hypothetical protein  97.45 
 
 
280 aa  278  8e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375208  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  43.48 
 
 
442 aa  276  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  46.83 
 
 
426 aa  276  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  46.83 
 
 
426 aa  276  5e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  42.42 
 
 
451 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  43.92 
 
 
415 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  42.66 
 
 
486 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  42.31 
 
 
486 aa  245  8e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  42.11 
 
 
458 aa  243  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0799  transposase, IS4 family protein  46.76 
 
 
313 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  41.85 
 
 
477 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  41.55 
 
 
486 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  41.27 
 
 
472 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  41.16 
 
 
491 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  41.16 
 
 
491 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  38.76 
 
 
495 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  38.76 
 
 
495 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  38.76 
 
 
495 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  38.76 
 
 
495 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  38.76 
 
 
495 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  38.28 
 
 
491 aa  216  5e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  38.28 
 
 
491 aa  216  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  38.28 
 
 
491 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  38.28 
 
 
491 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  38.28 
 
 
491 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  37.98 
 
 
408 aa  212  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  37.69 
 
 
529 aa  209  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  37.98 
 
 
408 aa  209  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  41.56 
 
 
423 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  37.98 
 
 
460 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  36.42 
 
 
438 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02569  transposase  43.12 
 
 
388 aa  189  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01806  transposase  39 
 
 
339 aa  189  7e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01571  transposase  43.8 
 
 
362 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01804  ISXoo5 transposase  39.92 
 
 
296 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103448  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  35.58 
 
 
435 aa  166  5e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00319  transposase  38.13 
 
 
390 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06260  ISXoo5 transposase  38.76 
 
 
296 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0310344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01098  ISXoo5 transposase  38.76 
 
 
296 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0546611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02101  transposase  42.54 
 
 
344 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02164  transposase  41.44 
 
 
266 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03351  putative ISXoo5 transposase  37.61 
 
 
415 aa  147  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0316  hypothetical protein  54.68 
 
 
168 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.957469  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00714  transposase  43.75 
 
 
231 aa  143  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00306145  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  41.12 
 
 
287 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02561  transposase (IS4 family)  43.98 
 
 
196 aa  138  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00299  transposase (IS4 family)  42.86 
 
 
180 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129029  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01849  transposase  44.51 
 
 
241 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04446  tRNA nucleotidyltransferase  44.76 
 
 
713 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0105255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04816  transposase  39.53 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01957  transposase (IS4 family)  42.13 
 
 
180 aa  114  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00639  transposase  44.03 
 
 
259 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03599  transposase  44.03 
 
 
259 aa  105  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03521  transposase  44.53 
 
 
130 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03204  transposase  43.28 
 
 
259 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03660  transposase  43.28 
 
 
259 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05578  IS1478 transposase  43.28 
 
 
259 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01423  transposase  43.28 
 
 
259 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03221  transposase  42.54 
 
 
259 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03512  transposase  44.85 
 
 
261 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01815  transposase  38.6 
 
 
161 aa  99.4  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00339826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00613  transposase  44.12 
 
 
261 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03921  transposase  44.12 
 
 
261 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00902  transposase  49.49 
 
 
288 aa  98.2  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00478777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03939  transposase  45.61 
 
 
268 aa  96.7  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.796315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03646  transposase  44.72 
 
 
267 aa  95.9  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02774  transposase  43.9 
 
 
302 aa  95.1  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03291  transposase  48.96 
 
 
230 aa  93.2  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4246  hypothetical protein  43.01 
 
 
270 aa  89.7  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4203  transposase, IS4  35.71 
 
 
231 aa  85.9  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2831  hypothetical protein  80 
 
 
89 aa  77.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02558  transposase  37.86 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254439  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04266  transposase  41.9 
 
 
123 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03349  transposase  41.38 
 
 
128 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02479  transposase  40.45 
 
 
102 aa  60.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02565  transposase  41.18 
 
 
100 aa  59.3  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03165  transposase  41.56 
 
 
121 aa  59.3  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1921  transposase, IS5 family, putative  26.78 
 
 
498 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0798  hypothetical protein  46.67 
 
 
166 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>