125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0799 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0799  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
313 aa  630  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  93.27 
 
 
448 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  88.55 
 
 
448 aa  530  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  61.34 
 
 
426 aa  322  5e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  61.34 
 
 
426 aa  322  5e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  57.89 
 
 
440 aa  322  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  57.89 
 
 
440 aa  322  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  57.89 
 
 
440 aa  322  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  57.89 
 
 
440 aa  322  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  57.89 
 
 
440 aa  322  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  57.89 
 
 
440 aa  322  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  60.22 
 
 
426 aa  321  9.000000000000001e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  57.65 
 
 
440 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  56.64 
 
 
374 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  56.93 
 
 
415 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  52.59 
 
 
451 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0316  hypothetical protein  91.36 
 
 
168 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.957469  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  50.53 
 
 
442 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  50.71 
 
 
458 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  51.06 
 
 
486 aa  252  7e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  93.33 
 
 
287 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  50.71 
 
 
486 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  50 
 
 
472 aa  249  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  50 
 
 
486 aa  249  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  50.18 
 
 
477 aa  248  1e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  46.21 
 
 
448 aa  241  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  46.21 
 
 
448 aa  241  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  46.21 
 
 
448 aa  241  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  49.82 
 
 
495 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  49.82 
 
 
495 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  49.82 
 
 
495 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  49.82 
 
 
495 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  49.82 
 
 
495 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  49.08 
 
 
451 aa  237  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3125  transposase, IS4 family protein  48.33 
 
 
360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  49.81 
 
 
491 aa  232  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  49.81 
 
 
491 aa  232  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  48.01 
 
 
460 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  42.27 
 
 
491 aa  229  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  42.27 
 
 
491 aa  229  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  46.21 
 
 
442 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  42.27 
 
 
491 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  45.05 
 
 
408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  41.96 
 
 
529 aa  225  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  45.05 
 
 
408 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  41.64 
 
 
491 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  41.64 
 
 
491 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01806  transposase  44.36 
 
 
339 aa  222  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  47.04 
 
 
412 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  51.27 
 
 
423 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1447  hypothetical protein  48.1 
 
 
323 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.551503  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  44.83 
 
 
448 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01804  ISXoo5 transposase  44.35 
 
 
296 aa  204  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06260  ISXoo5 transposase  43.95 
 
 
296 aa  198  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0310344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01098  ISXoo5 transposase  43.95 
 
 
296 aa  198  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0546611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02569  transposase  52.34 
 
 
388 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01571  transposase  56.32 
 
 
362 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02164  transposase  40.84 
 
 
266 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00319  transposase  46.73 
 
 
390 aa  171  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00714  transposase  50.56 
 
 
231 aa  169  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00306145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02101  transposase  55.62 
 
 
344 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3213  transposase, IS4 family protein  54.22 
 
 
181 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  37.13 
 
 
438 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01849  transposase  48.37 
 
 
241 aa  159  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02561  transposase (IS4 family)  48.52 
 
 
196 aa  155  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03351  putative ISXoo5 transposase  45.86 
 
 
415 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  34.72 
 
 
435 aa  144  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00299  transposase (IS4 family)  46.88 
 
 
180 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129029  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3775  hypothetical protein  91.43 
 
 
70 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.787753  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01957  transposase (IS4 family)  45.62 
 
 
180 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01815  transposase  44.44 
 
 
161 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00339826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04816  transposase  54.39 
 
 
306 aa  104  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02558  transposase  53.04 
 
 
147 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254439  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6011  putative transposase protein  69.7 
 
 
66 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04446  tRNA nucleotidyltransferase  58.54 
 
 
713 aa  89  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0105255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03521  transposase  59.46 
 
 
130 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00639  transposase  59.46 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03204  transposase  59.46 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03599  transposase  59.46 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03660  transposase  59.46 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01423  transposase  58.11 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03221  transposase  59.46 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4246  hypothetical protein  58.06 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05578  IS1478 transposase  58.11 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04266  transposase  43.62 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03921  transposase  57.89 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00613  transposase  57.89 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03512  transposase  57.89 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03349  transposase  42.05 
 
 
128 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3774  hypothetical protein  80.39 
 
 
98 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03165  transposase  43.75 
 
 
121 aa  63.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02774  transposase  61.82 
 
 
302 aa  63.5  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0342  hypothetical protein  48.15 
 
 
110 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0751083  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02565  transposase  44.3 
 
 
100 aa  62.8  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13421  transposase  29.33 
 
 
225 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.43078e-16  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03646  transposase  53.73 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4203  transposase, IS4  44.83 
 
 
231 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04257  transposase  39.24 
 
 
119 aa  60.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.770282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03939  transposase  61.54 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.796315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02479  transposase  44.93 
 
 
102 aa  57  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>