85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02558 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02558  transposase  100 
 
 
147 aa  284  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254439  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  95 
 
 
486 aa  259  6.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01571  transposase  93.57 
 
 
362 aa  254  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  91.43 
 
 
486 aa  249  7e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  90.71 
 
 
458 aa  248  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02569  transposase  91.43 
 
 
388 aa  248  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  90.71 
 
 
477 aa  246  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  90.71 
 
 
486 aa  246  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  90.71 
 
 
472 aa  246  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  90 
 
 
423 aa  246  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02101  transposase  89.29 
 
 
344 aa  243  4.9999999999999997e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  89.29 
 
 
491 aa  243  9e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  89.29 
 
 
491 aa  243  9e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04816  transposase  86.43 
 
 
306 aa  238  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04446  tRNA nucleotidyltransferase  90.52 
 
 
713 aa  202  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0105255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03512  transposase  95.1 
 
 
261 aa  183  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03921  transposase  94.12 
 
 
261 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00613  transposase  94.12 
 
 
261 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03221  transposase  92 
 
 
259 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03660  transposase  91 
 
 
259 aa  178  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03599  transposase  91 
 
 
259 aa  178  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01423  transposase  91 
 
 
259 aa  178  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05578  IS1478 transposase  91 
 
 
259 aa  178  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03204  transposase  91 
 
 
259 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00639  transposase  90 
 
 
259 aa  175  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03521  transposase  90 
 
 
130 aa  175  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03646  transposase  94.05 
 
 
267 aa  158  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02774  transposase  94.05 
 
 
302 aa  159  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03939  transposase  93.83 
 
 
268 aa  150  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.796315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03351  putative ISXoo5 transposase  58.16 
 
 
415 aa  149  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00319  transposase  58.45 
 
 
390 aa  146  8e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  58.16 
 
 
408 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  58.16 
 
 
491 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  57.75 
 
 
491 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  57.45 
 
 
408 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  58.16 
 
 
491 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  57.75 
 
 
491 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  57.75 
 
 
491 aa  145  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  57.04 
 
 
529 aa  143  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  61.27 
 
 
495 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  61.27 
 
 
495 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  61.27 
 
 
495 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  61.27 
 
 
495 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  61.27 
 
 
495 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01806  transposase  57.04 
 
 
339 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03291  transposase  92.75 
 
 
230 aa  128  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00902  transposase  82.67 
 
 
288 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00478777  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  49.31 
 
 
374 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  50.72 
 
 
442 aa  121  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
426 aa  120  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  47.92 
 
 
440 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  47.92 
 
 
440 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  47.92 
 
 
440 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  47.92 
 
 
440 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  47.92 
 
 
440 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  47.92 
 
 
440 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  51.8 
 
 
448 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  49.64 
 
 
448 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  50.36 
 
 
287 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  46.43 
 
 
440 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  47.86 
 
 
426 aa  111  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  47.86 
 
 
426 aa  111  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  42.14 
 
 
451 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  48.55 
 
 
442 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  53.77 
 
 
412 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0799  transposase, IS4 family protein  53.04 
 
 
313 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  47.66 
 
 
451 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  47.15 
 
 
448 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  47.15 
 
 
448 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  47.15 
 
 
448 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  44.29 
 
 
415 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01804  ISXoo5 transposase  54.35 
 
 
296 aa  88.2  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01098  ISXoo5 transposase  54.84 
 
 
296 aa  87.8  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0546611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06260  ISXoo5 transposase  54.84 
 
 
296 aa  87.8  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0310344  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  51.04 
 
 
448 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  39.23 
 
 
460 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4246  hypothetical protein  47.19 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3125  transposase, IS4 family protein  38.76 
 
 
360 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343643  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3211  hypothetical protein  39.82 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375208  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4203  transposase, IS4  43.9 
 
 
231 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01849  transposase  78.95 
 
 
241 aa  63.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1447  hypothetical protein  47.83 
 
 
323 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.551503  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  35.85 
 
 
438 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02164  transposase  46.03 
 
 
266 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  29.41 
 
 
435 aa  47.4  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>