123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0313 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  587  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  94.06 
 
 		 448 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  94.06 
 
 		 448 aa  557  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  57.69 
 
 		 426 aa  328  7e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  58.04 
 
 		 426 aa  328  9e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  58.04 
 
 		 426 aa  328  9e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  56.94 
 
 		 440 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  56.79 
 
 		 440 aa  315  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  56.79 
 
 		 440 aa  315  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  56.79 
 
 		 440 aa  315  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  56.79 
 
 		 440 aa  315  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  56.79 
 
 		 440 aa  315  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  56.79 
 
 		 440 aa  315  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0798  hypothetical protein  92.9 
 
 		 166 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  52.88 
 
 		 451 aa  297  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  52.8 
 
 		 415 aa  295  8e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  51.77 
 
 		 442 aa  285  9e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  53.41 
 
 		 458 aa  277  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  50.17 
 
 		 442 aa  276  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02569  transposase  52.69 
 
 		 388 aa  275  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01571  transposase  53.41 
 
 		 362 aa  275  8e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  53.76 
 
 		 486 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  53.05 
 
 		 423 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  53.05 
 
 		 472 aa  273  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  53.05 
 
 		 477 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  52.69 
 
 		 486 aa  270  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  52.69 
 
 		 486 aa  270  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02101  transposase  52.33 
 
 		 344 aa  265  7e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  51.61 
 
 		 491 aa  260  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  51.61 
 
 		 491 aa  260  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0799  transposase, IS4 family protein  93.33 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  45.58 
 
 		 451 aa  247  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  48.94 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  48.94 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  48.94 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04816  transposase  51.34 
 
 		 306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  47.89 
 
 		 448 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4246  hypothetical protein  56.72 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04446  tRNA nucleotidyltransferase  53.98 
 
 		 713 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0105255  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  45.23 
 
 		 460 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03221  transposase  54.59 
 
 		 259 aa  225  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4203  transposase, IS4  52.5 
 
 		 231 aa  224  9e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03599  transposase  54.13 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00639  transposase  53.67 
 
 		 259 aa  221  8e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374906  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  54.82 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03660  transposase  53.67 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05578  IS1478 transposase  53.67 
 
 		 259 aa  219  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00613  transposase  54.09 
 
 		 261 aa  219  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03512  transposase  54.09 
 
 		 261 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03921  transposase  53.64 
 
 		 261 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01423  transposase  52.75 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03204  transposase  53.21 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  44.98 
 
 		 412 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  41.56 
 
 		 495 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  41.56 
 
 		 495 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  41.56 
 
 		 495 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  41.56 
 
 		 495 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  41.56 
 
 		 495 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02774  transposase  53.96 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  40.2 
 
 		 491 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03646  transposase  51.87 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  39.54 
 
 		 491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00319  transposase  39.87 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  39.54 
 
 		 491 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  39.87 
 
 		 491 aa  199  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03351  putative ISXoo5 transposase  39.87 
 
 		 415 aa  200  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  39.87 
 
 		 491 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03939  transposase  53.27 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.796315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  39.54 
 
 		 529 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00902  transposase  49.54 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00478777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03291  transposase  54.3 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  42.73 
 
 		 408 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  42.29 
 
 		 408 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  37.91 
 
 		 438 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3211  hypothetical protein  40.78 
 
 		 280 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375208  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  34.88 
 
 		 435 aa  171  1e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3775  hypothetical protein  92.86 
 
 		 70 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.787753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02255  transposase  52.67 
 
 		 186 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03521  transposase  54.26 
 
 		 130 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3125  transposase, IS4 family protein  41.12 
 
 		 360 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02554  transposase  52.89 
 
 		 162 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0840457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03992  transposase  53.64 
 
 		 151 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02629  transposase  53.64 
 
 		 151 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02558  transposase  50.36 
 
 		 147 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254439  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01806  transposase  40.38 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4299  transposase  27.82 
 
 		 508 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02654  transposase  53.06 
 
 		 189 aa  95.5  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01960  transposase  39.86 
 
 		 159 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0186456  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0812  hypothetical protein  36.96 
 
 		 153 aa  90.9  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3127  hypothetical protein  46.46 
 
 		 115 aa  90.5  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01073  transposase  47.96 
 
 		 128 aa  86.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06247  transposase  47.96 
 
 		 128 aa  86.3  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4186  hypothetical protein  26.63 
 
 		 509 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1432  transposase, IS5 family, putative  26.96 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0494  transposase, IS5 family, putative  26.96 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0722  transposase, IS5 family, putative  26.96 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000096619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0664  transposase, IS5 family, putative  26.96 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2434  transposase, IS5 family, putative  26.96 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1382  transposase, IS5 family, putative  26.96 
 
 		 498 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01804  ISXoo5 transposase  38.39 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>