59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3775 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3775  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.787753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  94.29 
 
 		 448 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  92.86 
 
 		 448 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  92.86 
 
 		 287 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0799  transposase, IS4 family protein  91.43 
 
 		 313 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  51.43 
 
 		 426 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  51.43 
 
 		 426 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  47.14 
 
 		 374 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  50.7 
 
 		 440 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  51.43 
 
 		 477 aa  63.9  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  51.43 
 
 		 486 aa  63.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  48.57 
 
 		 440 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  48.57 
 
 		 440 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  48.57 
 
 		 440 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  48.57 
 
 		 440 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  48.57 
 
 		 440 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  48.57 
 
 		 440 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  51.43 
 
 		 458 aa  63.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02569  transposase  51.43 
 
 		 388 aa  63.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  51.43 
 
 		 472 aa  62.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  51.43 
 
 		 486 aa  63.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  47.14 
 
 		 426 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  51.43 
 
 		 486 aa  61.6  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02101  transposase  51.43 
 
 		 344 aa  61.6  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  47.89 
 
 		 451 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  50 
 
 		 423 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  50 
 
 		 491 aa  60.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  50 
 
 		 491 aa  60.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01571  transposase  48.57 
 
 		 362 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  45.71 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  49.28 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  49.28 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  49.28 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  42.86 
 
 		 442 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  45.71 
 
 		 451 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  38.89 
 
 		 495 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  38.89 
 
 		 495 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  38.89 
 
 		 495 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  38.89 
 
 		 495 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  38.89 
 
 		 495 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  41.43 
 
 		 442 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01849  transposase  55.81 
 
 		 241 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3125  transposase, IS4 family protein  39.71 
 
 		 360 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  40.58 
 
 		 412 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00714  transposase  50 
 
 		 231 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00306145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  33.33 
 
 		 491 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  33.33 
 
 		 491 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01806  transposase  32.43 
 
 		 339 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  33.33 
 
 		 491 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00319  transposase  33.33 
 
 		 390 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  33.33 
 
 		 491 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03351  putative ISXoo5 transposase  33.33 
 
 		 415 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01804  ISXoo5 transposase  33.33 
 
 		 296 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  33.33 
 
 		 491 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01098  ISXoo5 transposase  33.33 
 
 		 296 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0546611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02164  transposase  32.43 
 
 		 266 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06260  ISXoo5 transposase  33.33 
 
 		 296 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0310344  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  35.29 
 
 		 435 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  36.23 
 
 		 438 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>