136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5151 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  100 
 
 
448 aa  925    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  100 
 
 
448 aa  925    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  100 
 
 
448 aa  925    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  69.86 
 
 
451 aa  626  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  74.35 
 
 
412 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  61.14 
 
 
448 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  47.58 
 
 
442 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  47.83 
 
 
442 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  45.87 
 
 
448 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  44.42 
 
 
440 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  44.42 
 
 
440 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  44.42 
 
 
440 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  44.42 
 
 
440 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  44.42 
 
 
440 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  44.42 
 
 
440 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  43.85 
 
 
451 aa  365  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  45.31 
 
 
448 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  45.22 
 
 
440 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  45.67 
 
 
426 aa  352  5e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  45.67 
 
 
426 aa  352  5e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  45.19 
 
 
426 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  43.57 
 
 
458 aa  330  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  42.99 
 
 
415 aa  330  3e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  43.38 
 
 
486 aa  328  9e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  43.51 
 
 
486 aa  326  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  41.76 
 
 
460 aa  326  6e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  43.05 
 
 
477 aa  324  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  42.7 
 
 
486 aa  320  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3125  transposase, IS4 family protein  52.62 
 
 
360 aa  318  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  43.41 
 
 
472 aa  317  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  43.22 
 
 
491 aa  309  6.999999999999999e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  43.22 
 
 
491 aa  309  6.999999999999999e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1447  hypothetical protein  55.87 
 
 
323 aa  292  8e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.551503  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  43.7 
 
 
423 aa  292  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  39.96 
 
 
495 aa  289  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  39.96 
 
 
495 aa  289  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  39.96 
 
 
495 aa  289  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  39.96 
 
 
495 aa  289  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  39.96 
 
 
495 aa  289  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  40.09 
 
 
491 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  39.87 
 
 
491 aa  286  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  39.87 
 
 
491 aa  286  5e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  39.64 
 
 
529 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  39.27 
 
 
491 aa  277  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  39.27 
 
 
491 aa  277  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  43.68 
 
 
374 aa  273  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02569  transposase  44.35 
 
 
388 aa  272  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01571  transposase  46.36 
 
 
362 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  42.28 
 
 
408 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  39.86 
 
 
438 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  42.01 
 
 
408 aa  260  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  39.1 
 
 
435 aa  257  4e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02101  transposase  45.34 
 
 
344 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  48.94 
 
 
287 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0799  transposase, IS4 family protein  46.21 
 
 
313 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00319  transposase  39.04 
 
 
390 aa  237  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3211  hypothetical protein  52.59 
 
 
280 aa  230  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375208  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03351  putative ISXoo5 transposase  39.53 
 
 
415 aa  223  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04446  tRNA nucleotidyltransferase  46.88 
 
 
713 aa  211  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0105255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04816  transposase  44.61 
 
 
306 aa  206  9e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00639  transposase  48.92 
 
 
259 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03599  transposase  49.34 
 
 
259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4203  transposase, IS4  44.98 
 
 
231 aa  199  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03204  transposase  48.48 
 
 
259 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05578  IS1478 transposase  48.48 
 
 
259 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03660  transposase  47.83 
 
 
259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01806  transposase  41 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01423  transposase  46.96 
 
 
259 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03221  transposase  47.83 
 
 
259 aa  195  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00613  transposase  48.07 
 
 
261 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03921  transposase  47.64 
 
 
261 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03512  transposase  48.05 
 
 
261 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03646  transposase  46.98 
 
 
267 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02774  transposase  46.26 
 
 
302 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01804  ISXoo5 transposase  42.91 
 
 
296 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103448  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3213  transposase, IS4 family protein  55.95 
 
 
181 aa  176  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00902  transposase  47.98 
 
 
288 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00478777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03939  transposase  46.92 
 
 
268 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.796315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01098  ISXoo5 transposase  42.52 
 
 
296 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0546611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06260  ISXoo5 transposase  42.52 
 
 
296 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0310344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03291  transposase  46.97 
 
 
230 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4246  hypothetical protein  40.4 
 
 
270 aa  160  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02164  transposase  41.96 
 
 
266 aa  150  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0798  hypothetical protein  46.26 
 
 
166 aa  133  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00714  transposase  39.8 
 
 
231 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00306145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02561  transposase (IS4 family)  40.35 
 
 
196 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0316  hypothetical protein  44.6 
 
 
168 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.957469  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02255  transposase  44.3 
 
 
186 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01849  transposase  39.66 
 
 
241 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02554  transposase  48.87 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0840457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03521  transposase  50 
 
 
130 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00299  transposase (IS4 family)  39.24 
 
 
180 aa  110  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129029  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02629  transposase  47.97 
 
 
151 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03992  transposase  47.97 
 
 
151 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01957  transposase (IS4 family)  38.75 
 
 
180 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3127  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  106  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1921  transposase, IS5 family, putative  27.95 
 
 
498 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4299  transposase  27.18 
 
 
508 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02654  transposase  46.61 
 
 
189 aa  99.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0494  transposase, IS5 family, putative  29.64 
 
 
498 aa  99  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>