144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0425 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  86.62 
 
 
426 aa  757    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
415 aa  852    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  86.15 
 
 
426 aa  744    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  86.15 
 
 
426 aa  744    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  64.51 
 
 
440 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  63.64 
 
 
440 aa  542  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  63.64 
 
 
440 aa  542  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  63.64 
 
 
440 aa  542  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  63.64 
 
 
440 aa  542  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  63.64 
 
 
440 aa  542  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  63.64 
 
 
440 aa  542  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  55.58 
 
 
448 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  55.82 
 
 
448 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  65.57 
 
 
374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  53.21 
 
 
458 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  52.49 
 
 
486 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  49.88 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  52.26 
 
 
486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  51.91 
 
 
472 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  52.26 
 
 
477 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  52.63 
 
 
486 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  46.56 
 
 
451 aa  398  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  51.33 
 
 
491 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  51.33 
 
 
491 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  51.28 
 
 
423 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  45.65 
 
 
442 aa  359  6e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  44.32 
 
 
495 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  44.32 
 
 
495 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  44.32 
 
 
495 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  44.32 
 
 
495 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  44.32 
 
 
495 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02569  transposase  51.09 
 
 
388 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4246  hypothetical protein  79.1 
 
 
270 aa  334  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  42.99 
 
 
448 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  42.99 
 
 
448 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  42.99 
 
 
448 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01571  transposase  53.37 
 
 
362 aa  325  7e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  42.44 
 
 
451 aa  320  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  42.08 
 
 
448 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  41.57 
 
 
491 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  41.57 
 
 
491 aa  311  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  40.47 
 
 
460 aa  309  5e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  41.35 
 
 
491 aa  309  5.9999999999999995e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  41.12 
 
 
529 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0799  transposase, IS4 family protein  56.93 
 
 
313 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  40.67 
 
 
491 aa  300  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  40.67 
 
 
491 aa  300  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  52.8 
 
 
287 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02101  transposase  51.6 
 
 
344 aa  295  1e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  44.26 
 
 
408 aa  288  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  43.01 
 
 
412 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  44.26 
 
 
408 aa  286  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00319  transposase  41.16 
 
 
390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  37.16 
 
 
438 aa  248  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03351  putative ISXoo5 transposase  40.85 
 
 
415 aa  239  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04816  transposase  48.31 
 
 
306 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3125  transposase, IS4 family protein  43.96 
 
 
360 aa  229  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01806  transposase  44.86 
 
 
339 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04446  tRNA nucleotidyltransferase  47.39 
 
 
713 aa  223  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0105255  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  35.92 
 
 
435 aa  219  5e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01804  ISXoo5 transposase  48.37 
 
 
296 aa  219  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03599  transposase  51.98 
 
 
259 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01098  ISXoo5 transposase  47.97 
 
 
296 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0546611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06260  ISXoo5 transposase  47.97 
 
 
296 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0310344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03660  transposase  51.54 
 
 
259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00639  transposase  51.54 
 
 
259 aa  212  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03204  transposase  51.1 
 
 
259 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05578  IS1478 transposase  51.1 
 
 
259 aa  210  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03221  transposase  50.22 
 
 
259 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01423  transposase  49.78 
 
 
259 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03921  transposase  50.22 
 
 
261 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00613  transposase  50.22 
 
 
261 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03512  transposase  50.66 
 
 
261 aa  203  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00714  transposase  58.82 
 
 
231 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00306145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02164  transposase  48.87 
 
 
266 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4203  transposase, IS4  45.97 
 
 
231 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02774  transposase  50.24 
 
 
302 aa  193  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03646  transposase  49.76 
 
 
267 aa  193  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03939  transposase  49.04 
 
 
268 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.796315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02561  transposase (IS4 family)  58.49 
 
 
196 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00902  transposase  49.5 
 
 
288 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00478777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01849  transposase  54.8 
 
 
241 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03291  transposase  50.26 
 
 
230 aa  180  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0798  hypothetical protein  56.29 
 
 
166 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1447  hypothetical protein  42.18 
 
 
323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.551503  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0316  hypothetical protein  61.48 
 
 
168 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.957469  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01957  transposase (IS4 family)  54.79 
 
 
180 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00299  transposase (IS4 family)  55.48 
 
 
180 aa  155  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129029  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3211  hypothetical protein  37.45 
 
 
280 aa  149  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375208  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3213  transposase, IS4 family protein  56.25 
 
 
181 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02255  transposase  51.41 
 
 
186 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01815  transposase  50.69 
 
 
161 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00339826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02554  transposase  52.76 
 
 
162 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0840457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03992  transposase  52.1 
 
 
151 aa  123  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02629  transposase  52.1 
 
 
151 aa  123  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03521  transposase  53.12 
 
 
130 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02654  transposase  47.37 
 
 
189 aa  99.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4299  transposase  24.45 
 
 
508 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04266  transposase  52.27 
 
 
123 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02558  transposase  44.29 
 
 
147 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.254439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>