78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02561 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02561  transposase (IS4 family)  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  93.26 
 
 
486 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  92.23 
 
 
486 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00714  transposase  93.26 
 
 
231 aa  362  1e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00306145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  92.23 
 
 
486 aa  362  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  91.71 
 
 
477 aa  360  6e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  91.19 
 
 
472 aa  359  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  90.67 
 
 
458 aa  357  8e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01957  transposase (IS4 family)  93.33 
 
 
180 aa  342  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00299  transposase (IS4 family)  90.56 
 
 
180 aa  328  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129029  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  89.51 
 
 
491 aa  291  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  89.51 
 
 
491 aa  291  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01849  transposase  94.04 
 
 
241 aa  290  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01815  transposase  77.22 
 
 
161 aa  248  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00339826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  92.91 
 
 
423 aa  240  7.999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  64.24 
 
 
495 aa  220  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  64.24 
 
 
495 aa  220  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  64.24 
 
 
495 aa  220  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  64.24 
 
 
495 aa  220  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  64.24 
 
 
495 aa  220  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04266  transposase  92.24 
 
 
123 aa  218  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  64.38 
 
 
491 aa  214  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  64.38 
 
 
491 aa  214  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02164  transposase  64.38 
 
 
266 aa  212  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01098  ISXoo5 transposase  64.38 
 
 
296 aa  211  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0546611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06260  ISXoo5 transposase  64.38 
 
 
296 aa  211  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0310344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01804  ISXoo5 transposase  63.03 
 
 
296 aa  211  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  63.75 
 
 
408 aa  210  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  63.75 
 
 
408 aa  210  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  63.12 
 
 
491 aa  208  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01806  transposase  63.12 
 
 
339 aa  207  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  63.75 
 
 
491 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  63.75 
 
 
491 aa  207  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  63.12 
 
 
529 aa  205  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  54.21 
 
 
440 aa  191  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  58.24 
 
 
440 aa  190  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  58.24 
 
 
440 aa  190  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  58.24 
 
 
440 aa  190  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  58.24 
 
 
440 aa  190  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  58.24 
 
 
440 aa  190  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  58.24 
 
 
440 aa  190  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03165  transposase  92 
 
 
121 aa  189  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02565  transposase  92 
 
 
100 aa  188  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  56.97 
 
 
374 aa  187  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  58.75 
 
 
426 aa  185  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  58.75 
 
 
426 aa  185  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  58.49 
 
 
415 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  57.5 
 
 
426 aa  181  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02569  transposase  90.53 
 
 
388 aa  175  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02479  transposase  89.47 
 
 
102 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  44.09 
 
 
451 aa  168  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  49.11 
 
 
442 aa  165  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  49.71 
 
 
448 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0799  transposase, IS4 family protein  48.52 
 
 
313 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  48.55 
 
 
448 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01571  transposase  89.61 
 
 
362 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1447  hypothetical protein  43.02 
 
 
323 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.551503  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  43.87 
 
 
442 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0316  hypothetical protein  49.26 
 
 
168 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.957469  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  44.44 
 
 
448 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  40.35 
 
 
448 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  40.35 
 
 
448 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  40.35 
 
 
448 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  41.92 
 
 
451 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3125  transposase, IS4 family protein  47.24 
 
 
360 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00319  transposase  65.88 
 
 
390 aa  124  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  38.65 
 
 
460 aa  118  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  42.94 
 
 
412 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  39.44 
 
 
438 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03349  transposase  63.86 
 
 
128 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3213  transposase, IS4 family protein  44.74 
 
 
181 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03351  putative ISXoo5 transposase  64 
 
 
415 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  43.84 
 
 
435 aa  96.3  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02101  transposase  92.16 
 
 
344 aa  96.7  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04257  transposase  60 
 
 
119 aa  87  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.770282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0342  hypothetical protein  61.9 
 
 
110 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0751083  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00320  ISXoo5 transposase  65.12 
 
 
87 aa  62.8  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445359  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13421  transposase  27.74 
 
 
225 aa  41.2  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.43078e-16  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>