71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02565 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02565  transposase  100 
 
 
100 aa  204  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  96 
 
 
486 aa  201  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00714  transposase  96 
 
 
231 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00306145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  94 
 
 
486 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  93 
 
 
458 aa  195  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  93 
 
 
472 aa  194  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04266  transposase  94 
 
 
123 aa  193  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  92 
 
 
477 aa  192  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01957  transposase (IS4 family)  93 
 
 
180 aa  191  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  91 
 
 
486 aa  190  5e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03165  transposase  93 
 
 
121 aa  189  9e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00299  transposase (IS4 family)  93 
 
 
180 aa  189  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129029  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02561  transposase (IS4 family)  92 
 
 
196 aa  188  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02479  transposase  93.68 
 
 
102 aa  181  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01815  transposase  87.01 
 
 
161 aa  141  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00339826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01849  transposase  96.55 
 
 
241 aa  121  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  94.92 
 
 
491 aa  120  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  94.92 
 
 
491 aa  120  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01098  ISXoo5 transposase  63.01 
 
 
296 aa  97.1  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0546611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06260  ISXoo5 transposase  63.01 
 
 
296 aa  97.1  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0310344  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  65.71 
 
 
495 aa  97.1  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  65.71 
 
 
495 aa  97.1  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  65.71 
 
 
495 aa  97.1  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  65.71 
 
 
495 aa  97.1  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  65.71 
 
 
495 aa  97.1  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  63.01 
 
 
408 aa  96.7  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  63.01 
 
 
408 aa  96.7  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  63.01 
 
 
491 aa  97.1  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  63.01 
 
 
491 aa  96.7  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01806  transposase  63.01 
 
 
339 aa  96.7  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02164  transposase  63.01 
 
 
266 aa  95.9  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03349  transposase  66.18 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01804  ISXoo5 transposase  61.64 
 
 
296 aa  92.8  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  61.64 
 
 
491 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  61.64 
 
 
491 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  61.64 
 
 
529 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  60.27 
 
 
491 aa  90.9  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04257  transposase  58.82 
 
 
119 aa  83.6  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.770282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0342  hypothetical protein  63.08 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0751083  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  40.91 
 
 
451 aa  77  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  54.29 
 
 
426 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  54.29 
 
 
426 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  52.24 
 
 
415 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  45.83 
 
 
442 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  42.39 
 
 
440 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  50 
 
 
426 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  94.12 
 
 
423 aa  69.3  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  44.16 
 
 
440 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  44.16 
 
 
440 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  44.16 
 
 
440 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  44.16 
 
 
440 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  44.16 
 
 
440 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  44.16 
 
 
440 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1447  hypothetical protein  45.21 
 
 
323 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.551503  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  47.14 
 
 
374 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  50 
 
 
448 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00320  ISXoo5 transposase  67.44 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445359  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0316  hypothetical protein  38.54 
 
 
168 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.957469  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  47.46 
 
 
442 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0799  transposase, IS4 family protein  44.3 
 
 
313 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  43.04 
 
 
448 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 
448 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 
448 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  42.86 
 
 
448 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  44.44 
 
 
448 aa  60.1  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  47.37 
 
 
451 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  46.15 
 
 
460 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3213  transposase, IS4 family protein  43.64 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3125  transposase, IS4 family protein  41.82 
 
 
360 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  43.75 
 
 
438 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  44.44 
 
 
412 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>