79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3213 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009467  Acry_3213  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
181 aa  368  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3125  transposase, IS4 family protein  92.49 
 
 
360 aa  300  6.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1447  hypothetical protein  64.5 
 
 
323 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.551503  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  55.95 
 
 
448 aa  188  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  55.95 
 
 
448 aa  188  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  57.8 
 
 
442 aa  188  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  55.95 
 
 
448 aa  188  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  54.27 
 
 
448 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  55.42 
 
 
448 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  57.14 
 
 
451 aa  170  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0799  transposase, IS4 family protein  54.22 
 
 
313 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  51.43 
 
 
440 aa  164  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  54.66 
 
 
374 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  55.9 
 
 
440 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  55.9 
 
 
440 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  52.69 
 
 
448 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  55.9 
 
 
440 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  55.9 
 
 
440 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  55.9 
 
 
440 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  55.9 
 
 
440 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  57.24 
 
 
426 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  58.5 
 
 
412 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  57.24 
 
 
426 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  49.67 
 
 
451 aa  155  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  56.76 
 
 
415 aa  154  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  54.61 
 
 
426 aa  154  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0316  hypothetical protein  56.12 
 
 
168 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.957469  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  42.44 
 
 
442 aa  132  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  46.84 
 
 
495 aa  130  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  46.84 
 
 
495 aa  130  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  46.84 
 
 
495 aa  130  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  46.84 
 
 
495 aa  130  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  46.84 
 
 
495 aa  130  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  48.39 
 
 
460 aa  125  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00299  transposase (IS4 family)  43.43 
 
 
180 aa  121  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.129029  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01804  ISXoo5 transposase  44.03 
 
 
296 aa  121  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  44.03 
 
 
408 aa  120  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  44.03 
 
 
408 aa  120  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  44.03 
 
 
491 aa  120  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  44.03 
 
 
491 aa  120  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  44.03 
 
 
529 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02164  transposase  44.03 
 
 
266 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  44.03 
 
 
491 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  41.71 
 
 
486 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  43.4 
 
 
491 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  43.4 
 
 
491 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02561  transposase (IS4 family)  42.86 
 
 
196 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00714  transposase  41.81 
 
 
231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00306145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01098  ISXoo5 transposase  42.77 
 
 
296 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0546611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06260  ISXoo5 transposase  42.77 
 
 
296 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0310344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  42.29 
 
 
458 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01957  transposase (IS4 family)  42.69 
 
 
180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  40.94 
 
 
486 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01806  transposase  42.77 
 
 
339 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  40.11 
 
 
486 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  40.94 
 
 
477 aa  112  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  39.55 
 
 
472 aa  111  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  37.65 
 
 
438 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01815  transposase  41.67 
 
 
161 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00339826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  40.82 
 
 
491 aa  97.8  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  40.82 
 
 
491 aa  97.8  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01849  transposase  41.84 
 
 
241 aa  95.9  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  41.29 
 
 
435 aa  81.6  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  41.8 
 
 
423 aa  82  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2831  hypothetical protein  77.78 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04266  transposase  41.12 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00319  transposase  48.1 
 
 
390 aa  68.2  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03349  transposase  42.53 
 
 
128 aa  67  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02569  transposase  44.58 
 
 
388 aa  63.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02479  transposase  39.56 
 
 
102 aa  62  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04257  transposase  40.74 
 
 
119 aa  61.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.770282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03165  transposase  41.03 
 
 
121 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02565  transposase  41.03 
 
 
100 aa  59.3  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03351  putative ISXoo5 transposase  51.79 
 
 
415 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01571  transposase  48.21 
 
 
362 aa  55.1  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0342  hypothetical protein  41.43 
 
 
110 aa  54.7  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0751083  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00320  ISXoo5 transposase  47.92 
 
 
87 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445359  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6011  putative transposase protein  49.02 
 
 
66 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308088  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0192  hypothetical protein  22.62 
 
 
473 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>