29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2831 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2831  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  176  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3125  transposase, IS4 family protein  80 
 
 		 360 aa  77.4  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343643  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3213  transposase, IS4 family protein  77.78 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.772851  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  65.91 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1447  hypothetical protein  60 
 
 		 323 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.551503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  57.14 
 
 		 412 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0799  transposase, IS4 family protein  58.54 
 
 		 313 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  58.54 
 
 		 374 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  58.54 
 
 		 448 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0316  hypothetical protein  58.54 
 
 		 168 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.957469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  54.76 
 
 		 448 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  54.76 
 
 		 448 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  54.76 
 
 		 448 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  56.1 
 
 		 440 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  54.76 
 
 		 451 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  56.1 
 
 		 440 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  56.1 
 
 		 440 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  56.1 
 
 		 440 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  56.1 
 
 		 440 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  56.1 
 
 		 440 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  56.1 
 
 		 440 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  48 
 
 		 448 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  56.1 
 
 		 448 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 426 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  50 
 
 		 426 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  46.67 
 
 		 451 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  48 
 
 		 426 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 415 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  60.71 
 
 		 460 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>