44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6011 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_6011  putative transposase protein  100 
 
 		 66 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308088  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0799  transposase, IS4 family protein  69.7 
 
 		 313 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  69.7 
 
 		 448 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  66.67 
 
 		 448 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0316  hypothetical protein  71.21 
 
 		 168 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.957469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3774  hypothetical protein  77.55 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  50.91 
 
 		 440 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  50.91 
 
 		 440 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  50.91 
 
 		 440 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  50.91 
 
 		 440 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  50.91 
 
 		 440 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  50.91 
 
 		 440 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  58 
 
 		 440 aa  57  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  71.43 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  80 
 
 		 426 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  80 
 
 		 426 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  74.29 
 
 		 415 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  60 
 
 		 451 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1447  hypothetical protein  50 
 
 		 323 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.551503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  71.43 
 
 		 426 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  56.41 
 
 		 442 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  57.14 
 
 		 495 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  57.14 
 
 		 495 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  57.14 
 
 		 495 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  57.14 
 
 		 495 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  57.14 
 
 		 495 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  57.14 
 
 		 491 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  57.14 
 
 		 529 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  57.14 
 
 		 491 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  57.14 
 
 		 491 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01804  ISXoo5 transposase  57.14 
 
 		 296 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103448  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  43.1 
 
 		 460 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0342  hypothetical protein  46.81 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0751083  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  57.14 
 
 		 408 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  57.14 
 
 		 491 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  57.14 
 
 		 408 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  57.14 
 
 		 491 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01098  ISXoo5 transposase  57.14 
 
 		 296 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0546611  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01806  transposase  57.14 
 
 		 339 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02164  transposase  57.14 
 
 		 266 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00320  ISXoo5 transposase  38.16 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03349  transposase  38.16 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06260  ISXoo5 transposase  57.14 
 
 		 296 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0310344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04257  transposase  40.79 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.770282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>