19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3774 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3774  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0799  transposase, IS4 family protein  80.39 
 
 		 313 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  76.47 
 
 		 448 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  77.55 
 
 		 448 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6011  putative transposase protein  77.55 
 
 		 66 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308088  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0316  hypothetical protein  84.78 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.957469  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  55.81 
 
 		 440 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  55.81 
 
 		 440 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  55.81 
 
 		 440 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  55.81 
 
 		 440 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  55.81 
 
 		 440 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  55.81 
 
 		 440 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  72.73 
 
 		 426 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  69.7 
 
 		 426 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  69.7 
 
 		 426 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  64.71 
 
 		 415 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  56.41 
 
 		 440 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  52.27 
 
 		 374 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1447  hypothetical protein  51.43 
 
 		 323 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.551503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>