122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02554 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02554  transposase  100 
 
 		 162 aa  330  6e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0840457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  97.48 
 
 		 486 aa  325  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03291  transposase  96.86 
 
 		 230 aa  322  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05578  IS1478 transposase  95.6 
 
 		 259 aa  318  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03221  transposase  94.97 
 
 		 259 aa  315  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  94.34 
 
 		 423 aa  315  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  94.97 
 
 		 486 aa  313  6e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00639  transposase  90.74 
 
 		 259 aa  313  9e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03512  transposase  94.34 
 
 		 261 aa  312  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04816  transposase  93.71 
 
 		 306 aa  312  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02774  transposase  91.98 
 
 		 302 aa  310  5.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00902  transposase  91.98 
 
 		 288 aa  309  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00478777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01423  transposase  93.71 
 
 		 259 aa  309  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03599  transposase  93.08 
 
 		 259 aa  308  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04446  tRNA nucleotidyltransferase  93.08 
 
 		 713 aa  309  1e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0105255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03204  transposase  93.71 
 
 		 259 aa  308  2.9999999999999997e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02101  transposase  93.08 
 
 		 344 aa  306  5.9999999999999995e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00613  transposase  92.45 
 
 		 261 aa  305  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03939  transposase  93.08 
 
 		 268 aa  306  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.796315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03921  transposase  92.45 
 
 		 261 aa  303  8.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  91.19 
 
 		 486 aa  300  6.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03660  transposase  89.94 
 
 		 259 aa  298  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  90.57 
 
 		 491 aa  296  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  90.57 
 
 		 491 aa  296  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02255  transposase  94 
 
 		 186 aa  290  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02629  transposase  96.03 
 
 		 151 aa  291  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  93.79 
 
 		 472 aa  283  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  90.67 
 
 		 477 aa  282  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03646  transposase  93.79 
 
 		 267 aa  281  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03992  transposase  92.05 
 
 		 151 aa  281  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01571  transposase  93.06 
 
 		 362 aa  277  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  96.18 
 
 		 458 aa  263  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02569  transposase  93.89 
 
 		 388 aa  261  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02654  transposase  86.99 
 
 		 189 aa  249  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06247  transposase  91.53 
 
 		 128 aa  220  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100358  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01073  transposase  91.53 
 
 		 128 aa  220  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00953  transposase  95.89 
 
 		 86 aa  140  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06213  transposase  95.89 
 
 		 86 aa  140  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.846656  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  55.93 
 
 		 426 aa  138  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  55.83 
 
 		 440 aa  134  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  53.54 
 
 		 426 aa  133  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  53.54 
 
 		 426 aa  133  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  52.76 
 
 		 415 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  55 
 
 		 440 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  55 
 
 		 440 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  55 
 
 		 440 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  55 
 
 		 440 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  55 
 
 		 440 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  55 
 
 		 440 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  55.08 
 
 		 442 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  53.72 
 
 		 448 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  53.72 
 
 		 448 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  52.89 
 
 		 287 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  55.83 
 
 		 448 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0798  hypothetical protein  52.07 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  46.67 
 
 		 451 aa  121  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01849  transposase  93.65 
 
 		 241 aa  121  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  45.71 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  45.71 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  45.71 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  45.71 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  45.71 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4203  transposase, IS4  47.5 
 
 		 231 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  47.5 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4246  hypothetical protein  49.14 
 
 		 270 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  45.3 
 
 		 442 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  48.87 
 
 		 448 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  48.87 
 
 		 448 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  48.87 
 
 		 448 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3211  hypothetical protein  53.21 
 
 		 280 aa  114  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375208  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01376  hypothetical protein  91.94 
 
 		 73 aa  114  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  49.11 
 
 		 460 aa  110  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  42.14 
 
 		 491 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01960  transposase  40.71 
 
 		 159 aa  107  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0186456  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00319  transposase  40.71 
 
 		 390 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  41.43 
 
 		 529 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  40.71 
 
 		 491 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  54.17 
 
 		 412 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  40.71 
 
 		 491 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03351  putative ISXoo5 transposase  40.71 
 
 		 415 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  40 
 
 		 491 aa  104  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  40 
 
 		 491 aa  104  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  46.85 
 
 		 438 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03520  transposase  96.08 
 
 		 51 aa  99.4  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  40.16 
 
 		 435 aa  97.8  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3127  hypothetical protein  51.65 
 
 		 115 aa  89.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01808  transposase  53.12 
 
 		 65 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0952062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  49.23 
 
 		 408 aa  74.7  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0812  hypothetical protein  33.63 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  47.69 
 
 		 408 aa  70.9  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03163  hypothetical protein  88.89 
 
 		 46 aa  68.6  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.545643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1382  transposase, IS5 family, putative  37.38 
 
 		 498 aa  67.4  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0494  transposase, IS5 family, putative  37.38 
 
 		 498 aa  67.4  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0722  transposase, IS5 family, putative  37.38 
 
 		 498 aa  67.4  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000096619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0664  transposase, IS5 family, putative  37.38 
 
 		 498 aa  67.4  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2434  transposase, IS5 family, putative  37.38 
 
 		 498 aa  67.4  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1432  transposase, IS5 family, putative  37.38 
 
 		 498 aa  67.4  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03521  transposase  81.25 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1921  transposase, IS5 family, putative  35.34 
 
 		 498 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0174  IS1478 transposase  43.42 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0597653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>