107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_06247 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01073  transposase  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06247  transposase  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100358  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03221  transposase  91.53 
 
 		 259 aa  228  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  90.68 
 
 		 423 aa  228  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04446  tRNA nucleotidyltransferase  90.68 
 
 		 713 aa  227  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0105255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00613  transposase  89.83 
 
 		 261 aa  224  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  89.83 
 
 		 472 aa  224  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05578  IS1478 transposase  89.83 
 
 		 259 aa  223  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  89.83 
 
 		 486 aa  223  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  89.83 
 
 		 486 aa  223  8e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03646  transposase  89.83 
 
 		 267 aa  222  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03921  transposase  89.83 
 
 		 261 aa  222  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00639  transposase  85.95 
 
 		 259 aa  221  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  89.83 
 
 		 486 aa  221  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01571  transposase  88.98 
 
 		 362 aa  222  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03204  transposase  88.98 
 
 		 259 aa  221  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03512  transposase  89.83 
 
 		 261 aa  221  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02554  transposase  91.53 
 
 		 162 aa  220  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0840457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00902  transposase  89.83 
 
 		 288 aa  220  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00478777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03599  transposase  88.98 
 
 		 259 aa  219  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02101  transposase  88.14 
 
 		 344 aa  219  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02255  transposase  88.98 
 
 		 186 aa  219  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02629  transposase  88.43 
 
 		 151 aa  218  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01423  transposase  88.14 
 
 		 259 aa  218  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03291  transposase  88.98 
 
 		 230 aa  218  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03939  transposase  88.98 
 
 		 268 aa  218  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.796315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  88.14 
 
 		 491 aa  218  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  88.14 
 
 		 491 aa  218  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03660  transposase  86.44 
 
 		 259 aa  216  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04816  transposase  87.29 
 
 		 306 aa  216  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03992  transposase  88.98 
 
 		 151 aa  215  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02774  transposase  87.29 
 
 		 302 aa  214  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02654  transposase  84.5 
 
 		 189 aa  213  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  83.9 
 
 		 477 aa  206  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  90.09 
 
 		 458 aa  206  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02569  transposase  87.39 
 
 		 388 aa  203  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00953  transposase  96.15 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06213  transposase  96.15 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.846656  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3211  hypothetical protein  51.02 
 
 		 280 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  47.52 
 
 		 442 aa  92  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  47.96 
 
 		 426 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  43.33 
 
 		 495 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  43.33 
 
 		 495 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  43.33 
 
 		 495 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  43.33 
 
 		 495 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  43.33 
 
 		 495 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  50.51 
 
 		 448 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  43.43 
 
 		 451 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  47.96 
 
 		 448 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  46.73 
 
 		 426 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  46.73 
 
 		 426 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  46.08 
 
 		 460 aa  87.4  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  45.54 
 
 		 448 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  45.54 
 
 		 448 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  45.54 
 
 		 448 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  45.87 
 
 		 448 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01960  transposase  40.83 
 
 		 159 aa  86.7  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0186456  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  47.96 
 
 		 287 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  44.86 
 
 		 415 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  47.42 
 
 		 440 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3127  hypothetical protein  50.55 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  46.39 
 
 		 440 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  46.39 
 
 		 440 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  46.39 
 
 		 440 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  46.39 
 
 		 440 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  46.39 
 
 		 440 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  46.39 
 
 		 440 aa  83.6  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00319  transposase  40 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  40.83 
 
 		 529 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  40.83 
 
 		 491 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01849  transposase  95.12 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  40 
 
 		 491 aa  82  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03351  putative ISXoo5 transposase  40 
 
 		 415 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03520  transposase  82.35 
 
 		 51 aa  82  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  38.32 
 
 		 442 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  40 
 
 		 491 aa  82  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  39.17 
 
 		 491 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  39.17 
 
 		 491 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0798  hypothetical protein  44.04 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4246  hypothetical protein  43.75 
 
 		 270 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 451 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01376  hypothetical protein  92.68 
 
 		 73 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4203  transposase, IS4  40 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  49.33 
 
 		 412 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  43.96 
 
 		 438 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  35.87 
 
 		 435 aa  65.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0812  hypothetical protein  31.96 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01808  transposase  56.1 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0952062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03165  transposase  88.89 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  51.22 
 
 		 408 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  51.22 
 
 		 408 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0174  IS1478 transposase  38.96 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0597653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2434  transposase, IS5 family, putative  32.58 
 
 		 498 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0494  transposase, IS5 family, putative  32.58 
 
 		 498 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0664  transposase, IS5 family, putative  32.58 
 
 		 498 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0722  transposase, IS5 family, putative  32.58 
 
 		 498 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000096619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1382  transposase, IS5 family, putative  32.58 
 
 		 498 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1432  transposase, IS5 family, putative  32.58 
 
 		 498 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1921  transposase, IS5 family, putative  32.58 
 
 		 498 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4186  hypothetical protein  29.07 
 
 		 509 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>