128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02255 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02255  transposase  100 
 
 
186 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05578  IS1478 transposase  95.27 
 
 
259 aa  332  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.957263  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03221  transposase  95.71 
 
 
259 aa  328  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03541  transposase  95.09 
 
 
423 aa  327  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497923  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00613  transposase  94.08 
 
 
261 aa  327  9e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01836  putative ISXoo4 transposase  93.49 
 
 
486 aa  325  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03947  ISXoo4 transposase  93.49 
 
 
486 aa  324  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00639  transposase  92.31 
 
 
259 aa  322  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03204  transposase  93.49 
 
 
259 aa  322  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03660  transposase  93.49 
 
 
259 aa  322  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03921  transposase  92.9 
 
 
261 aa  322  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04446  tRNA nucleotidyltransferase  93.45 
 
 
713 aa  322  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0105255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04816  transposase  92.9 
 
 
306 aa  322  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00701  putative ISXoo4 transposase  92.31 
 
 
486 aa  321  4e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01423  transposase  92.9 
 
 
259 aa  321  4e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01802  putative ISXoo4 transposase  93.49 
 
 
477 aa  320  8e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02774  transposase  92.9 
 
 
302 aa  319  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03291  transposase  92.31 
 
 
230 aa  319  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03512  transposase  92.31 
 
 
261 aa  319  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02101  transposase  92.31 
 
 
344 aa  319  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03599  transposase  92.9 
 
 
259 aa  318  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03677  putative ISXoo4 transposase  95.57 
 
 
472 aa  317  5e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03939  transposase  91.72 
 
 
268 aa  316  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.796315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00902  transposase  91.72 
 
 
288 aa  314  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00478777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03646  transposase  93.87 
 
 
267 aa  314  6e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  91.12 
 
 
491 aa  311  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  91.12 
 
 
491 aa  311  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01571  transposase  94.3 
 
 
362 aa  310  6.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.805285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02554  transposase  94 
 
 
162 aa  290  6e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0840457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02569  transposase  93.96 
 
 
388 aa  288  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03350  ISXoo4 transposase  93.96 
 
 
458 aa  285  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02629  transposase  94.37 
 
 
151 aa  276  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03992  transposase  92.25 
 
 
151 aa  267  5.9999999999999995e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02654  transposase  89.78 
 
 
189 aa  245  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06247  transposase  88.98 
 
 
128 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100358  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01073  transposase  88.98 
 
 
128 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0672  transposase IS4  55.71 
 
 
442 aa  154  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4647  transposase, IS4 family protein  54.14 
 
 
426 aa  147  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  53.68 
 
 
440 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  52.94 
 
 
440 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  52.94 
 
 
440 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  52.94 
 
 
440 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  52.94 
 
 
440 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  52.94 
 
 
440 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  52.94 
 
 
440 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  51.37 
 
 
426 aa  142  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  51.37 
 
 
426 aa  142  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0425  transposase, IS4 family protein  51.41 
 
 
415 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352527  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  52.63 
 
 
448 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  53.44 
 
 
448 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0313  hypothetical protein  52.67 
 
 
287 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0105  transposase, IS4 family protein  45.45 
 
 
495 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0281  transposase, IS4 family protein  45.45 
 
 
495 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0508  transposase, IS4 family protein  45.45 
 
 
495 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1377  transposase, IS4 family protein  45.45 
 
 
495 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3679  transposase, IS4 family protein  45.45 
 
 
495 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1771  putative transposase  51.11 
 
 
448 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.10371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4205  transposase IS4 family protein  46.67 
 
 
451 aa  131  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4203  transposase, IS4  46.67 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0798  hypothetical protein  51.13 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2758  transposase, IS4  44.44 
 
 
451 aa  129  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0869213  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4246  hypothetical protein  48.09 
 
 
270 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.780286  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  44.03 
 
 
442 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06213  transposase  95.31 
 
 
86 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.846656  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00953  transposase  95.31 
 
 
86 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03661  ISXoo5 transposase  43.14 
 
 
491 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3827  transposase IS4 family protein  44.3 
 
 
448 aa  121  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5151  transposase IS4 family protein  44.3 
 
 
448 aa  121  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0725  transposase IS4 family protein  44.3 
 
 
448 aa  121  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02758  ISXoo5 transposase  42.48 
 
 
529 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1457  transposase, IS4 family protein  48.41 
 
 
460 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00319  transposase  41.83 
 
 
390 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00229  ISXoo5 transposase  41.83 
 
 
491 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01949  ISXoo5 transposase  41.83 
 
 
491 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03351  putative ISXoo5 transposase  41.83 
 
 
415 aa  118  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06224  ISXoo5 transposase  41.18 
 
 
491 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01090  ISXoo5 transposase  41.18 
 
 
491 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3211  hypothetical protein  53.21 
 
 
280 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7278  transposase  50 
 
 
412 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01960  transposase  41.38 
 
 
159 aa  112  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0186456  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01849  transposase  92.59 
 
 
241 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  43.65 
 
 
438 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01376  hypothetical protein  90.57 
 
 
73 aa  99  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0461  ISPg7, transposase  39.32 
 
 
435 aa  98.2  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03520  transposase  90.2 
 
 
51 aa  94  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03521  transposase  87.76 
 
 
130 aa  91.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3127  hypothetical protein  51.65 
 
 
115 aa  90.5  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00632  transposase  50.65 
 
 
408 aa  85.9  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110086  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00697  transposase  49.35 
 
 
408 aa  82  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0812  hypothetical protein  29.23 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01808  transposase  54.69 
 
 
65 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0952062  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1382  transposase, IS5 family, putative  36.45 
 
 
498 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2434  transposase, IS5 family, putative  36.45 
 
 
498 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0722  transposase, IS5 family, putative  36.45 
 
 
498 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000096619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0664  transposase, IS5 family, putative  36.45 
 
 
498 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0494  transposase, IS5 family, putative  36.45 
 
 
498 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1432  transposase, IS5 family, putative  36.45 
 
 
498 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01821  transposase  46.58 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000045905  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1921  transposase, IS5 family, putative  35.51 
 
 
498 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7398  transposase IS4 family protein  56.36 
 
 
374 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.535746  normal  0.891617 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>