50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1219 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1826  transposase IS4 family protein  100 
 
 
450 aa  934    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1384  transposase IS4 family protein  100 
 
 
450 aa  934    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1219  transposase IS4 family protein  100 
 
 
450 aa  934    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0660  transposase IS4 family protein  100 
 
 
450 aa  934    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1827  transposase IS4 family protein  100 
 
 
450 aa  934    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3250  transposase IS4 family protein  100 
 
 
450 aa  934    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.494916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1799  transposase, IS4 family protein  38.48 
 
 
446 aa  277  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.65035  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2390  transposase, IS4 family protein  38.48 
 
 
446 aa  277  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1213  transposase, IS4 family protein  38.48 
 
 
446 aa  277  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0383  transposase, IS4 family protein  38.48 
 
 
446 aa  277  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792291  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1809  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.5 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1808  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.5 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1807  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.5 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0695  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.5 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.776838  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0120  hypothetical protein  24.45 
 
 
493 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1413  hypothetical protein  24.45 
 
 
493 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.435798  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1922  hypothetical protein  24.45 
 
 
493 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0193891  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2297  hypothetical protein  24.45 
 
 
493 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2347  hypothetical protein  24.45 
 
 
493 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2646  hypothetical protein  24.45 
 
 
493 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2156  IS5 family transposase  32.97 
 
 
260 aa  91.3  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0340068 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0377  transposase IS4 family protein  26.35 
 
 
329 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.88086  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1456  transposase IS4 family protein  26.35 
 
 
329 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0420  hypothetical protein  35.33 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2622  transposase IS4 family protein  23.89 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000619925  hitchhiker  0.00356568 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2155  transposase IS4  28.65 
 
 
174 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0585469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13420  transposase  27.59 
 
 
234 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000844303  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13421  transposase  23.5 
 
 
225 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.43078e-16  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1432  transposase, IS5 family, putative  22.22 
 
 
498 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2434  transposase, IS5 family, putative  22.22 
 
 
498 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1382  transposase, IS5 family, putative  22.22 
 
 
498 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0722  transposase, IS5 family, putative  22.22 
 
 
498 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000096619 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0664  transposase, IS5 family, putative  22.22 
 
 
498 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0494  transposase, IS5 family, putative  22.22 
 
 
498 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4039  hypothetical protein  25 
 
 
448 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.415702 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11052  transposase  23.94 
 
 
163 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.677186  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4299  transposase  22.4 
 
 
508 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4186  hypothetical protein  24.59 
 
 
509 aa  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1394  transposase, IS4 family protein  24.1 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0616685 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1749  transposase, IS4 family protein  24.1 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2849  ISPg7, transposase  27.69 
 
 
438 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1921  transposase, IS5 family, putative  21.62 
 
 
498 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0843  IRSO9 transposase protein  25.14 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3123  ISRSO9-transposase protein  25.14 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3145  ISRSO9-transposase protein  25.14 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.519223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3421  ISRSO9-transposase protein  25.14 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0155  ISRSO9-transposase protein  25.14 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00277876  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0584  ISRSO9-transposase protein  25.14 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21421  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0478  transposase, IS4 family protein  23.78 
 
 
448 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0019  putative transposase  23.08 
 
 
440 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786306  normal  0.704407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>