30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0120 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2646  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  1018    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2347  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  1018    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2297  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  1018    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1922  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  1018    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0193891  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0120  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  1018    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1413  hypothetical protein  100 
 
 
493 aa  1018    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.435798  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1456  transposase IS4 family protein  68.45 
 
 
329 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0377  transposase IS4 family protein  68.45 
 
 
329 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.88086  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1457  hypothetical protein  78.48 
 
 
165 aa  240  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.442942  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1826  transposase IS4 family protein  24.45 
 
 
450 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3250  transposase IS4 family protein  24.45 
 
 
450 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.494916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1827  transposase IS4 family protein  24.45 
 
 
450 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1384  transposase IS4 family protein  24.45 
 
 
450 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1219  transposase IS4 family protein  24.45 
 
 
450 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0660  transposase IS4 family protein  24.45 
 
 
450 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2155  transposase IS4  28.82 
 
 
174 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0585469 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0695  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27 
 
 
464 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.776838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1807  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27 
 
 
464 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148493  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1808  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27 
 
 
464 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1809  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27 
 
 
464 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13421  transposase  25 
 
 
225 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.43078e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11052  transposase  26.42 
 
 
163 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.677186  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0383  transposase, IS4 family protein  24.3 
 
 
446 aa  52  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.792291  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2390  transposase, IS4 family protein  24.3 
 
 
446 aa  52  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1799  transposase, IS4 family protein  24.3 
 
 
446 aa  52  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.65035  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1213  transposase, IS4 family protein  24.3 
 
 
446 aa  52  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4299  transposase  21.76 
 
 
508 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1447  hypothetical protein  28.74 
 
 
323 aa  47.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.551503  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06094  transposase (IS4 family) protein  27.33 
 
 
491 aa  43.9  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05628  transposase (IS4 family) protein  27.33 
 
 
491 aa  43.9  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.167373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>