101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3699 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  100 
 
 
680 aa  1376    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  48.82 
 
 
558 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  48.82 
 
 
558 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  41.56 
 
 
522 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  40.51 
 
 
559 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  40.51 
 
 
594 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  41.56 
 
 
522 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  41.56 
 
 
522 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  41.56 
 
 
522 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  41.56 
 
 
522 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  41.56 
 
 
522 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  41.56 
 
 
522 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  41.56 
 
 
522 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  41.56 
 
 
522 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  41.56 
 
 
522 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  41.56 
 
 
522 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  41.56 
 
 
522 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  41.56 
 
 
522 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  48.22 
 
 
502 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  38.79 
 
 
569 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  38.79 
 
 
551 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  38.79 
 
 
551 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  40.16 
 
 
566 aa  334  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  40.16 
 
 
566 aa  334  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  40.16 
 
 
566 aa  334  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  42.44 
 
 
554 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  42.45 
 
 
406 aa  330  7e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  39.22 
 
 
559 aa  319  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  38.4 
 
 
553 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  38.4 
 
 
553 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  38.4 
 
 
553 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  38.4 
 
 
553 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  38.4 
 
 
553 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  37.41 
 
 
585 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  37.41 
 
 
585 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  37.41 
 
 
585 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  37.41 
 
 
585 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  37.41 
 
 
585 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  39.39 
 
 
559 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4013  transposase IS4 family protein  42.02 
 
 
483 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5548  hypothetical protein  41.78 
 
 
490 aa  277  5e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0234  transposase IS4  39.43 
 
 
424 aa  272  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  35.98 
 
 
511 aa  262  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  42.03 
 
 
442 aa  249  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2968  hypothetical protein  45.52 
 
 
272 aa  233  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1875  transposase  48.46 
 
 
360 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.590508 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  41.52 
 
 
352 aa  179  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1874  hypothetical protein  48.75 
 
 
229 aa  151  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2969  transposase  35.54 
 
 
223 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0233  transposase  51.58 
 
 
97 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  30.04 
 
 
508 aa  92.8  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  29.37 
 
 
508 aa  92.8  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  30.04 
 
 
508 aa  92.8  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  30.04 
 
 
508 aa  92.8  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  30.04 
 
 
508 aa  92.8  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  29.82 
 
 
508 aa  91.3  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  29.15 
 
 
508 aa  83.6  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  26.62 
 
 
515 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  26.62 
 
 
515 aa  77.4  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  26.62 
 
 
515 aa  77.4  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  26.62 
 
 
515 aa  77.4  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  26.62 
 
 
515 aa  77.4  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
517 aa  71.2  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
517 aa  70.1  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
517 aa  70.1  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4420  hypothetical protein  24.31 
 
 
575 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187576  normal  0.765326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
517 aa  69.7  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
517 aa  69.7  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
517 aa  69.7  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
517 aa  69.7  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
517 aa  69.7  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
517 aa  69.7  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
517 aa  69.7  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  27.59 
 
 
517 aa  69.7  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  27.54 
 
 
515 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  27.54 
 
 
515 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  27.54 
 
 
515 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3053  hypothetical protein  50.72 
 
 
140 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  27.96 
 
 
453 aa  62  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  23.19 
 
 
518 aa  58.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  23.19 
 
 
518 aa  58.2  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1873  transposase, IS4  30.13 
 
 
213 aa  57.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0290  hypothetical protein  22.27 
 
 
548 aa  57.4  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0216247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0310  hypothetical protein  22.27 
 
 
548 aa  57.4  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0514  hypothetical protein  22.27 
 
 
548 aa  57.4  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0718  hypothetical protein  22.27 
 
 
515 aa  57.4  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1592  hypothetical protein  22.27 
 
 
548 aa  57.4  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1757  hypothetical protein  22.27 
 
 
548 aa  57.4  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  25.32 
 
 
576 aa  54.3  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4015  hypothetical protein  46.43 
 
 
106 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  28.83 
 
 
363 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2511  hypothetical protein  46.43 
 
 
106 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0101  hypothetical protein  37.5 
 
 
454 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3344  transposase IS4 family protein  27.32 
 
 
336 aa  48.5  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0129  transposase  44.23 
 
 
83 aa  47.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0758  putative transposase IS4  28.92 
 
 
275 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0860229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5546  hypothetical protein  44.64 
 
 
106 aa  45.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  28.08 
 
 
497 aa  44.3  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  28.08 
 
 
497 aa  44.3  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1012  transposase  29.89 
 
 
504 aa  43.9  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662877  normal  0.9413 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>