More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_2032 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  94.88 
 
 
508 aa  974    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  94.69 
 
 
508 aa  972    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  94.69 
 
 
508 aa  972    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  94.69 
 
 
508 aa  972    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  94.49 
 
 
508 aa  971    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  94.69 
 
 
508 aa  972    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  100 
 
 
508 aa  1028    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  47.41 
 
 
515 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  47.41 
 
 
515 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  47.41 
 
 
515 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  47.51 
 
 
515 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  47.22 
 
 
517 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  47.22 
 
 
517 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  47.22 
 
 
517 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  47.22 
 
 
517 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  47.22 
 
 
517 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  47.6 
 
 
515 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  47.6 
 
 
515 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  47.6 
 
 
515 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  47.6 
 
 
515 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  47.22 
 
 
517 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  47.22 
 
 
517 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  47.22 
 
 
517 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  47.02 
 
 
517 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  47.41 
 
 
515 aa  395  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  47.02 
 
 
517 aa  395  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  47.02 
 
 
517 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  45.6 
 
 
453 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  30.33 
 
 
518 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  30.33 
 
 
518 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  31.8 
 
 
576 aa  158  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2451  hypothetical protein  25.05 
 
 
513 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  27.56 
 
 
566 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  27.56 
 
 
566 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  27.56 
 
 
566 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  25.48 
 
 
559 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  25.48 
 
 
594 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  26.82 
 
 
558 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  26.82 
 
 
558 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  25.54 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  25.54 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  25.54 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  25.54 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  25.54 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  25.54 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  25.54 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  25.54 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  25.54 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  25.54 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  25.54 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  25.54 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  25.54 
 
 
522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  24.62 
 
 
551 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  24.62 
 
 
551 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  24.62 
 
 
569 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  27.4 
 
 
511 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1656  transposase IS4 family protein  22.06 
 
 
486 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.129974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0718  hypothetical protein  21.91 
 
 
515 aa  81.3  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0290  hypothetical protein  21.91 
 
 
548 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0216247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0310  hypothetical protein  21.91 
 
 
548 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0514  hypothetical protein  21.91 
 
 
548 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1592  hypothetical protein  21.91 
 
 
548 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1757  hypothetical protein  21.91 
 
 
548 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  38.93 
 
 
553 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  38.93 
 
 
553 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  38.93 
 
 
553 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  38.93 
 
 
553 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  38.93 
 
 
553 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2968  hypothetical protein  38.14 
 
 
272 aa  77  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  35.17 
 
 
559 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  37.84 
 
 
559 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  38.14 
 
 
406 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0233  transposase  41.67 
 
 
97 aa  73.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  36.44 
 
 
680 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  34.78 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1875  transposase  31.21 
 
 
360 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.590508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4420  hypothetical protein  23.38 
 
 
575 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187576  normal  0.765326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5003  transposase IS4 family protein  29.39 
 
 
468 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.600524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2964  transposase IS4 family protein  29.39 
 
 
468 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  34.33 
 
 
585 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  34.33 
 
 
585 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  34.33 
 
 
585 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0153  transposase IS4 family protein  23.61 
 
 
557 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000196095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  34.33 
 
 
585 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  34.33 
 
 
585 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0575  transposase IS4 family protein  23.61 
 
 
547 aa  62  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000022159  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  24.77 
 
 
502 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  34.29 
 
 
442 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1005  transposase IS4 family protein  23.61 
 
 
557 aa  58.5  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000370054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0420  hypothetical protein  31.78 
 
 
246 aa  57  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1524  transposase  23.52 
 
 
493 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1876  putative transposase  27.49 
 
 
305 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0792  transposase, IS4 family protein  23.04 
 
 
577 aa  55.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1172  hypothetical protein  21.49 
 
 
462 aa  55.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0849908 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1178  hypothetical protein  21.06 
 
 
512 aa  55.8  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.216502 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0960  hypothetical protein  21.49 
 
 
461 aa  55.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1012  transposase  23.33 
 
 
504 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662877  normal  0.9413 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2538  ISBma2, transposase  23.52 
 
 
493 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  24.79 
 
 
457 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  24.79 
 
 
457 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>