86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4420 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4420  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1187    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187576  normal  0.765326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1757  hypothetical protein  29.85 
 
 		 548 aa  224  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1592  hypothetical protein  29.85 
 
 		 548 aa  224  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0514  hypothetical protein  29.85 
 
 		 548 aa  224  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0310  hypothetical protein  29.85 
 
 		 548 aa  224  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0290  hypothetical protein  29.85 
 
 		 548 aa  224  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0216247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0718  hypothetical protein  29.69 
 
 		 515 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  27.46 
 
 		 553 aa  100  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  27.46 
 
 		 553 aa  100  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  27.46 
 
 		 553 aa  100  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  27.46 
 
 		 553 aa  100  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  27.46 
 
 		 553 aa  100  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  27.07 
 
 		 559 aa  87  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  25.42 
 
 		 559 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  25.33 
 
 		 551 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  25.33 
 
 		 569 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  25.33 
 
 		 551 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  22.92 
 
 		 585 aa  73.9  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  22.92 
 
 		 585 aa  73.9  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  22.92 
 
 		 585 aa  73.9  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  22.92 
 
 		 585 aa  73.9  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  22.92 
 
 		 585 aa  73.9  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  24.49 
 
 		 511 aa  73.9  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  25.06 
 
 		 566 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  25.06 
 
 		 566 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  25.06 
 
 		 566 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  22.97 
 
 		 517 aa  72  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  22.97 
 
 		 517 aa  72  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  22.97 
 
 		 517 aa  72  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  23.56 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  23.56 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  23.56 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  23.56 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  23.56 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  23.56 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  23.56 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  24.18 
 
 		 508 aa  69.7  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  23.33 
 
 		 517 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  23.58 
 
 		 594 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  23.58 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  24.18 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  24.18 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  24.18 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  24.18 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  24.18 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  23.58 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  23.58 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  23.58 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  23.58 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  23.58 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  23.58 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  23.58 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  23.58 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  23.58 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  23.58 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  23.58 
 
 		 559 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  23.58 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  23.58 
 
 		 522 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  25.43 
 
 		 558 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  25.43 
 
 		 558 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  24.63 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  24.22 
 
 		 680 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  27.88 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  29.27 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  23.38 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  25.39 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  23.13 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  23.13 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  23.13 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  23.13 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  23.3 
 
 		 515 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  23.3 
 
 		 515 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  23.3 
 
 		 515 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5548  hypothetical protein  23.92 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  26.53 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  22.9 
 
 		 515 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2098  hypothetical protein  42.39 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  23.56 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  29.86 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0234  transposase IS4  23.94 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4013  transposase IS4 family protein  23.73 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  21.72 
 
 		 518 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  21.72 
 
 		 518 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2968  hypothetical protein  25.74 
 
 		 272 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  24.43 
 
 		 576 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3666  transposase IS4 family protein  32.58 
 
 		 442 aa  43.9  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.850388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>