More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0138 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0138  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  852    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0521  hypothetical protein  63.79 
 
 
406 aa  552  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0892728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0741  hypothetical protein  64.04 
 
 
406 aa  551  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.420464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1056  hypothetical protein  64.04 
 
 
406 aa  551  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1166  hypothetical protein  63.79 
 
 
406 aa  552  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1343  hypothetical protein  64.04 
 
 
406 aa  551  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1747  hypothetical protein  63.79 
 
 
406 aa  552  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1881  hypothetical protein  63.79 
 
 
406 aa  552  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2465  hypothetical protein  63.79 
 
 
406 aa  552  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.712536  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2502  hypothetical protein  63.79 
 
 
406 aa  552  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0709  hypothetical protein  63.3 
 
 
406 aa  545  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0720  hypothetical protein  63.55 
 
 
406 aa  547  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0534  transposase, IS4 family protein  47.8 
 
 
411 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2001  hypothetical protein  65.62 
 
 
288 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0523  transposase IS4 family protein  44.2 
 
 
399 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1658  transposase IS4 family protein  44.2 
 
 
399 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2313  transposase IS4 family protein  44.2 
 
 
399 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0503  transposase IS4 family protein  44.44 
 
 
399 aa  361  1e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2979  hypothetical protein  58.13 
 
 
164 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.492693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0188  transposase IS1182 family protein  26.82 
 
 
452 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0978  transposase IS1182 family protein  26.82 
 
 
452 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0965  transposase IS1182 family protein  26.82 
 
 
452 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2214  transposase I1182 family protein  26.82 
 
 
452 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0088029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4663  transposase IS1182 family protein  26.82 
 
 
452 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0375  transposase IS1182 family protein  26.84 
 
 
452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1527  transposase IS1182 family protein  26.84 
 
 
452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0929  transposase IS1182 family protein  26.84 
 
 
452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0831  transposase IS1182 family protein  26.84 
 
 
452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000267898  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0399  transposase, IS4 family protein  25.79 
 
 
443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.646351  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0432  transposase, IS4 family protein  25.79 
 
 
443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0428  transposase, IS4 family protein  25.79 
 
 
443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0218  transposase, IS4 family protein  25.79 
 
 
443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0215  transposase, IS4 family protein  25.79 
 
 
443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2194  transposase, IS4 family protein  25.57 
 
 
443 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1503  transposase, IS4 family protein  25.57 
 
 
443 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0173  transposase, IS4 family protein  25.57 
 
 
443 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0159  transposase, IS4 family protein  25.57 
 
 
443 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1502  transposase, IS4 family protein  25.57 
 
 
443 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.342679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1752  transposase, IS4 family protein  25.57 
 
 
443 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0587  transposase, IS4 family protein  25.57 
 
 
443 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1735  transposase, IS4 family protein  25.57 
 
 
443 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0257  transposase, IS4 family protein  25.57 
 
 
443 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.251859  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1246  transposase, IS4 family protein  25.57 
 
 
443 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000500369  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1705  hypothetical protein  30.5 
 
 
495 aa  90.5  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0152  hypothetical protein  33.81 
 
 
320 aa  89  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000580282  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1267  transposase IS4 family protein  26.11 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2852  hypothetical protein  31.31 
 
 
131 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00308029  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  25.37 
 
 
320 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  25.37 
 
 
320 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  25.37 
 
 
320 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  25.37 
 
 
320 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  25.37 
 
 
320 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  25.37 
 
 
320 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  27.83 
 
 
316 aa  59.3  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  25.87 
 
 
320 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  25.22 
 
 
338 aa  57  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  25.22 
 
 
338 aa  57  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  25.22 
 
 
338 aa  57  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0210  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0489  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0714  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1467  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0317213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1565  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.004757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1627  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0994008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1662  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.627269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1816  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2310  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2314  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0761785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2619  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2970  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.646128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3076  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3325  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3346  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3107  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3193  hypothetical protein  25 
 
 
304 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0691373  normal  0.0616674 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2276  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.540999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0934  IS5 transposase  25.81 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4707  IS5 transposase  25.81 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0642  IS5 transposase  25.93 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0956986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2257  IS5 transposase  25.93 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4088  IS5 transposase  25.81 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0322419  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0652  IS5 transposase  25.81 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4726  IS5 transposase  25.81 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1856  IS5 transposase  25.81 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.859503  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3892  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1124  IS5 transposase  25.81 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0023  IS5 transposase  25.81 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.938635  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3314  IS5 transposase  25.81 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2076  IS5 transposase  25.81 
 
 
326 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1941  hypothetical protein  23.56 
 
 
472 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2748  transposase, IS4  23.71 
 
 
311 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1315  hypothetical protein  23.32 
 
 
472 aa  53.1  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00094296  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0655  transposase IS4 family protein  22.87 
 
 
311 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.927973  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  22.63 
 
 
559 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1070  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  26.39 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1803  putative transposase  25.95 
 
 
368 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  25.79 
 
 
281 aa  50.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  21.82 
 
 
360 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  21.82 
 
 
360 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>