68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2001 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2001  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  606  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0521  hypothetical protein  98.96 
 
 
406 aa  600  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0892728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1747  hypothetical protein  98.96 
 
 
406 aa  600  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1343  hypothetical protein  98.61 
 
 
406 aa  601  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1166  hypothetical protein  98.96 
 
 
406 aa  600  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1056  hypothetical protein  98.61 
 
 
406 aa  601  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0741  hypothetical protein  98.61 
 
 
406 aa  601  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.420464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1881  hypothetical protein  98.96 
 
 
406 aa  600  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2465  hypothetical protein  98.96 
 
 
406 aa  600  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.712536  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2502  hypothetical protein  98.96 
 
 
406 aa  600  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0709  hypothetical protein  98.61 
 
 
406 aa  598  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0720  hypothetical protein  98.26 
 
 
406 aa  596  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0138  hypothetical protein  65.62 
 
 
406 aa  410  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0534  transposase, IS4 family protein  52.4 
 
 
411 aa  315  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0523  transposase IS4 family protein  48.39 
 
 
399 aa  279  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1658  transposase IS4 family protein  48.39 
 
 
399 aa  279  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2313  transposase IS4 family protein  48.39 
 
 
399 aa  279  5e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0503  transposase IS4 family protein  47.04 
 
 
399 aa  275  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2979  hypothetical protein  55.76 
 
 
164 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.492693  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0152  hypothetical protein  32.56 
 
 
320 aa  85.9  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000580282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0965  transposase IS1182 family protein  30 
 
 
452 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2214  transposase I1182 family protein  30 
 
 
452 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0088029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0978  transposase IS1182 family protein  30 
 
 
452 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4663  transposase IS1182 family protein  30 
 
 
452 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0188  transposase IS1182 family protein  30 
 
 
452 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993815  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1705  hypothetical protein  32.09 
 
 
495 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0929  transposase IS1182 family protein  29.2 
 
 
452 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0375  transposase IS1182 family protein  29.2 
 
 
452 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0831  transposase IS1182 family protein  29.2 
 
 
452 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000267898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1527  transposase IS1182 family protein  29.2 
 
 
452 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0428  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1246  transposase, IS4 family protein  24.2 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000500369  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0432  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0399  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.646351  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0257  transposase, IS4 family protein  24.2 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.251859  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0218  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0215  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0173  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0159  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0587  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1502  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.342679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1503  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1735  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1752  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2194  transposase, IS4 family protein  24.36 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1267  transposase IS4 family protein  26.45 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1941  hypothetical protein  28.11 
 
 
472 aa  50.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3193  hypothetical protein  26.07 
 
 
304 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0691373  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1315  hypothetical protein  28.11 
 
 
472 aa  50.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00094296  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2852  hypothetical protein  47.73 
 
 
131 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00308029  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1906  hypothetical protein  28.34 
 
 
266 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0076  transposase IS4 family protein  30.32 
 
 
321 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0258707  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1110  transposase IS4 family protein  30.32 
 
 
321 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1561  transposase IS4 family protein  30.32 
 
 
321 aa  43.5  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.983286 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02158  hypothetical protein  28.07 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  32.69 
 
 
320 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  32.69 
 
 
320 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  32.69 
 
 
320 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  32.69 
 
 
320 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  32.69 
 
 
320 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  32.69 
 
 
320 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  25.9 
 
 
360 aa  42.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  25.9 
 
 
360 aa  42.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05850  hypothetical protein  28.07 
 
 
306 aa  42.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  33.02 
 
 
320 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4142  IS4 family transposase  30 
 
 
326 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.282209 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  29.57 
 
 
316 aa  42.4  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  32.41 
 
 
316 aa  42.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>