217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0720 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0521  hypothetical protein  99.26 
 
 
406 aa  846    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0892728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0709  hypothetical protein  99.51 
 
 
406 aa  850    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0720  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  853    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0741  hypothetical protein  99.01 
 
 
406 aa  842    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.420464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1056  hypothetical protein  99.01 
 
 
406 aa  842    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1166  hypothetical protein  99.26 
 
 
406 aa  846    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1343  hypothetical protein  99.01 
 
 
406 aa  842    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1747  hypothetical protein  99.26 
 
 
406 aa  846    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1881  hypothetical protein  99.26 
 
 
406 aa  846    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2465  hypothetical protein  99.26 
 
 
406 aa  846    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.712536  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2502  hypothetical protein  99.26 
 
 
406 aa  846    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2001  hypothetical protein  98.26 
 
 
288 aa  596  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0138  hypothetical protein  63.55 
 
 
406 aa  547  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0534  transposase, IS4 family protein  46.76 
 
 
411 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0503  transposase IS4 family protein  44.85 
 
 
399 aa  352  5e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2313  transposase IS4 family protein  45.34 
 
 
399 aa  349  4e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0523  transposase IS4 family protein  45.34 
 
 
399 aa  349  4e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1658  transposase IS4 family protein  45.34 
 
 
399 aa  349  4e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2979  hypothetical protein  55.76 
 
 
164 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.492693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0929  transposase IS1182 family protein  26.86 
 
 
452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0375  transposase IS1182 family protein  26.86 
 
 
452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0831  transposase IS1182 family protein  26.86 
 
 
452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000267898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1527  transposase IS1182 family protein  26.86 
 
 
452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0215  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 
443 aa  97.1  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0218  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 
443 aa  97.1  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0399  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 
443 aa  97.1  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.646351  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0432  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 
443 aa  97.1  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0428  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 
443 aa  97.1  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0159  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 
443 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2194  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 
443 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0173  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 
443 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0587  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 
443 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1502  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 
443 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.342679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1735  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 
443 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1503  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 
443 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1752  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 
443 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0257  transposase, IS4 family protein  24.37 
 
 
443 aa  94  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.251859  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1246  transposase, IS4 family protein  24.37 
 
 
443 aa  94  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000500369  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0188  transposase IS1182 family protein  30.99 
 
 
452 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0965  transposase IS1182 family protein  30.99 
 
 
452 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0978  transposase IS1182 family protein  30.99 
 
 
452 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4663  transposase IS1182 family protein  30.99 
 
 
452 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2214  transposase I1182 family protein  30.99 
 
 
452 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0088029  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  31.55 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  31.55 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  31.55 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  31.55 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  31.55 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  31.55 
 
 
320 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0152  hypothetical protein  32.56 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000580282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  32.69 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1705  hypothetical protein  32.09 
 
 
495 aa  80.1  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2852  hypothetical protein  36.63 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00308029  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  27.88 
 
 
316 aa  63.5  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0655  transposase IS4 family protein  25.11 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.927973  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1267  transposase IS4 family protein  26.45 
 
 
274 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1704  ISRSO18-transposase protein  29.27 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0125656  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1941  hypothetical protein  25.67 
 
 
472 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1315  hypothetical protein  25.67 
 
 
472 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00094296  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3344  transposase IS4 family protein  25.64 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2748  transposase, IS4  25.4 
 
 
311 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327226  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  24.3 
 
 
360 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  24.3 
 
 
360 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  27.23 
 
 
334 aa  54.7  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0076  transposase IS4 family protein  28.21 
 
 
321 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0258707  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1561  transposase IS4 family protein  28.21 
 
 
321 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.983286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1110  transposase IS4 family protein  28.21 
 
 
321 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1136  ISRSO18-transposase protein  27.8 
 
 
321 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.835296  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4142  IS4 family transposase  27.81 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.282209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24660  Transposase, IS4  24.64 
 
 
335 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49770  IS4 family transposase  24.64 
 
 
335 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26840  Transposase, IS4  24.64 
 
 
335 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16640  Transposase, IS4  24.64 
 
 
335 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36450  Transposase, IS4  24.64 
 
 
335 aa  50.8  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  26.24 
 
 
445 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  26.6 
 
 
358 aa  50.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  26.24 
 
 
349 aa  50.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3193  hypothetical protein  26.5 
 
 
304 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0691373  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0604  transposase, IS4 family protein  28.87 
 
 
314 aa  49.7  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3712  transposase, IS4 family protein  28.87 
 
 
314 aa  49.7  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3832  transposase, IS4 family protein  28.87 
 
 
314 aa  49.7  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.42 
 
 
281 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.89 
 
 
281 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2276  transposase IS4 family protein  27.37 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.540999  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  28.29 
 
 
316 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0960  hypothetical protein  23.56 
 
 
461 aa  48.9  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1856  IS5 transposase  27.37 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.859503  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  26.24 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1178  hypothetical protein  23.56 
 
 
512 aa  48.9  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.216502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1124  IS5 transposase  27.37 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4726  IS5 transposase  27.37 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0023  IS5 transposase  27.37 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.938635  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0652  IS5 transposase  27.37 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0934  IS5 transposase  27.37 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2257  IS5 transposase  27.37 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2076  IS5 transposase  27.37 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3314  IS5 transposase  27.37 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4707  IS5 transposase  27.37 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4088  IS5 transposase  27.37 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0322419  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0642  IS5 transposase  27.37 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0956986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>