More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4268 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  100 
 
 		 330 aa  686    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  87.61 
 
 		 358 aa  585  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  87.61 
 
 		 445 aa  586  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  86.69 
 
 		 349 aa  541  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  59.15 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  51.28 
 
 		 327 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1308  ISRSO18-transposase protein  52.92 
 
 		 320 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0569  IS5 transposase  48.87 
 
 		 326 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0800  IS5 transposase  48.87 
 
 		 326 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3838  transposase, IS4 family protein  46.3 
 
 		 326 aa  308  8e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231978 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0947  IS5 transposase  48.55 
 
 		 326 aa  308  8e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  51.28 
 
 		 326 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  50.96 
 
 		 326 aa  305  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  50.96 
 
 		 326 aa  305  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  50.96 
 
 		 326 aa  305  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  50.96 
 
 		 326 aa  305  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4823  transposase IS4 family protein  50.48 
 
 		 326 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  49.68 
 
 		 326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0618  ISRSO18-transposase protein  50.97 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01747  IS5 transposase  45.66 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02453  IS5 transposase  45.66 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0522589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  51.77 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04439  ISXoo6 transposase  52.09 
 
 		 320 aa  299  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0171  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0534  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0780  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0844  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0902  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0903  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1166  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1188  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.584401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1229  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.520476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1310  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1315  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2008  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2010  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2234  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2324  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000979415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2328  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00380976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2426  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2432  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000860937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2541  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2836  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2887  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00537517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3194  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0837027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3208  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0135274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3731  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0359746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3963  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4152  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4253  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4347  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4596  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4643  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4702  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4971  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5428  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5440  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5556  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5564  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5582  ISPssy, transposase  50.96 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03428  ISXoo6 transposase  52.73 
 
 		 320 aa  299  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03937  ISXoo6 transposase  52.73 
 
 		 405 aa  299  5e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32190  Transposase, IS4 protein  49.68 
 
 		 326 aa  298  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02301  ISXoo6 transposase  52.73 
 
 		 326 aa  298  7e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01501  ISXoo6 transposase  51.77 
 
 		 331 aa  298  8e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02738  ISXo1 transposase  51.13 
 
 		 322 aa  298  9e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1714  transposase IS4 family protein  47.1 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  50 
 
 		 327 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2847  transposase IS4 family protein  47.1 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1042  transposase, IS4 family protein  47.1 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.077617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1156  transposase, IS4 family protein  47.1 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01862  ISXo1 transposase  50.81 
 
 		 322 aa  296  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04748  ISXo1 transposase  50.81 
 
 		 322 aa  296  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1110  transposase IS4 family protein  48.38 
 
 		 321 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05689  ISXo1 transposase  50.81 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05625  ISXo1 transposase  50.81 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0316217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06239  ISXo1 transposase  50.81 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06088  ISXo1 transposase  50.81 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0076  transposase IS4 family protein  48.38 
 
 		 321 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0258707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05516  ISXo1 transposase  50.81 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00284  ISXo1 transposase  50.81 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.454777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04167  ISXo1 transposase  50.81 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1561  transposase IS4 family protein  48.38 
 
 		 321 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.983286 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04722  ISXo1 transposase  50.81 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04603  ISXo1 transposase  50.81 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01080  ISXo1 transposase  50.81 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000904995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04707  ISXo1 transposase  50.81 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04850  ISXo1 transposase  50.81 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0577284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00491  ISXo1 transposase  50.81 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01858  ISXo1 transposase  50.81 
 
 		 322 aa  296  4e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0023  IS5 transposase  46.3 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.938635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1856  IS5 transposase  46.3 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.859503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4726  IS5 transposase  46.3 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1124  IS5 transposase  46.3 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2076  IS5 transposase  46.3 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0652  IS5 transposase  46.3 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04676  ISXo1 transposase  50.81 
 
 		 322 aa  295  5e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4088  IS5 transposase  46.3 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0322419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0934  IS5 transposase  46.3 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4707  IS5 transposase  46.3 
 
 		 326 aa  295  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>