More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4149 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  100 
 
 
358 aa  744    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  100 
 
 
445 aa  740    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  99.7 
 
 
349 aa  699    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  87.61 
 
 
330 aa  585  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  59.09 
 
 
316 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  51.71 
 
 
327 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0569  IS5 transposase  48.81 
 
 
326 aa  298  9e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0800  IS5 transposase  48.81 
 
 
326 aa  298  9e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1308  ISRSO18-transposase protein  53.47 
 
 
320 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0947  IS5 transposase  48.46 
 
 
326 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3838  transposase, IS4 family protein  46.76 
 
 
326 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4823  transposase IS4 family protein  50.34 
 
 
326 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0618  ISRSO18-transposase protein  51.39 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  49.66 
 
 
326 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  51.03 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  51.03 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  51.03 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  51.03 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02453  IS5 transposase  45.73 
 
 
326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0522589  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01747  IS5 transposase  45.73 
 
 
326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0171  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0534  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0780  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0844  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0902  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0903  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1166  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1188  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.584401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1229  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.520476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1310  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1315  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2008  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2010  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2234  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2324  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000979415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2328  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00380976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2426  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2432  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000860937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2541  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2836  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2887  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00537517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3194  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0837027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3208  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0135274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3731  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0359746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3963  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4152  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4253  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4347  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4596  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4643  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4702  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4971  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5428  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5440  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5556  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5564  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5582  ISPssy, transposase  51.03 
 
 
325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  51.03 
 
 
326 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1124  IS5 transposase  46.08 
 
 
326 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4707  IS5 transposase  46.08 
 
 
326 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3314  IS5 transposase  46.08 
 
 
326 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0023  IS5 transposase  46.08 
 
 
326 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.938635  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4088  IS5 transposase  46.08 
 
 
326 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0322419  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2076  IS5 transposase  46.08 
 
 
326 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1856  IS5 transposase  46.08 
 
 
326 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.859503  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0934  IS5 transposase  46.08 
 
 
326 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4726  IS5 transposase  46.08 
 
 
326 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0652  IS5 transposase  46.08 
 
 
326 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3889  ISMca7, transposase  75.12 
 
 
213 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3892  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
326 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2276  transposase IS4 family protein  45.73 
 
 
326 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.540999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0642  IS5 transposase  45.73 
 
 
330 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0956986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2257  IS5 transposase  45.73 
 
 
330 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2444  TIS1021-transposase protein  48.5 
 
 
337 aa  279  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2538  TIS1021-transposase protein  48.5 
 
 
337 aa  279  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.419682 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1662  transposase IS4 family protein  45.73 
 
 
326 aa  279  7e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.627269  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1053  TIS1021-transposase protein  48.5 
 
 
349 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.420746  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0854  TIS1021-transposase protein  48.5 
 
 
349 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2990  TIS1021-transposase protein  48.5 
 
 
349 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2988  TIS1021-transposase protein  48.5 
 
 
349 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2600  TIS1021-transposase protein  48.5 
 
 
349 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.90039  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2992  TIS1021-transposase protein  48.5 
 
 
349 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3327  TIS1021-transposase protein  48.5 
 
 
349 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50372  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3819  TIS1021-transposase protein  48.5 
 
 
349 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2965  TIS1021-transposase protein  48.5 
 
 
349 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0493876  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2596  TIS1021-transposase protein  48.5 
 
 
349 aa  278  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0489  transposase IS4 family protein  45.39 
 
 
326 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0714  transposase IS4 family protein  45.39 
 
 
326 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1467  transposase IS4 family protein  45.39 
 
 
326 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0317213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1565  transposase IS4 family protein  45.39 
 
 
326 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.004757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1627  transposase IS4 family protein  45.39 
 
 
326 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0994008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1816  transposase IS4 family protein  45.39 
 
 
326 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2310  transposase IS4 family protein  45.39 
 
 
326 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2314  transposase IS4 family protein  45.39 
 
 
326 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0761785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2619  transposase IS4 family protein  45.39 
 
 
326 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2970  transposase IS4 family protein  45.39 
 
 
326 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.646128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3076  transposase IS4 family protein  45.39 
 
 
326 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3325  transposase IS4 family protein  45.39 
 
 
326 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4142  IS4 family transposase  45.39 
 
 
326 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.282209 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3107  transposase IS4 family protein  45.39 
 
 
326 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
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