288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3889 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3889  ISMca7, transposase  100 
 
 		 213 aa  443  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.707432  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  75.12 
 
 		 445 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  74.63 
 
 		 330 aa  280  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  75.12 
 
 		 358 aa  280  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  96.88 
 
 		 349 aa  261  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  47.37 
 
 		 316 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3832  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 314 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0604  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 314 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3712  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 314 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216949  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4027  transposase, IS4 family protein  45.77 
 
 		 326 aa  175  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0970154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2847  transposase IS4 family protein  45.27 
 
 		 317 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1714  transposase IS4 family protein  45.27 
 
 		 317 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1042  transposase, IS4 family protein  45.27 
 
 		 317 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.077617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1156  transposase, IS4 family protein  45.27 
 
 		 317 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04848  ISXoo6 transposase  48.99 
 
 		 339 aa  169  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01501  ISXoo6 transposase  48.48 
 
 		 331 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543852  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  47.5 
 
 		 326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  47.5 
 
 		 326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  47.5 
 
 		 326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  47.5 
 
 		 326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03428  ISXoo6 transposase  49.49 
 
 		 320 aa  165  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0642  IS5 transposase  42.72 
 
 		 330 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0956986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2257  IS5 transposase  42.72 
 
 		 330 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01370  ISXoo6 transposase  49.49 
 
 		 329 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04439  ISXoo6 transposase  48.48 
 
 		 320 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3892  transposase IS4 family protein  42.72 
 
 		 326 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2276  transposase IS4 family protein  42.72 
 
 		 326 aa  164  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.540999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4726  IS5 transposase  42.72 
 
 		 326 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02301  ISXoo6 transposase  49.49 
 
 		 326 aa  164  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4088  IS5 transposase  42.72 
 
 		 326 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0322419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03937  ISXoo6 transposase  49.49 
 
 		 405 aa  164  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4707  IS5 transposase  42.72 
 
 		 326 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0023  IS5 transposase  42.72 
 
 		 326 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.938635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0934  IS5 transposase  42.72 
 
 		 326 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0652  IS5 transposase  42.72 
 
 		 326 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1856  IS5 transposase  42.72 
 
 		 326 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.859503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1124  IS5 transposase  42.72 
 
 		 326 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3314  IS5 transposase  42.72 
 
 		 326 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2076  IS5 transposase  42.72 
 
 		 326 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0800  IS5 transposase  46.49 
 
 		 326 aa  164  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0569  IS5 transposase  46.49 
 
 		 326 aa  164  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04727  ISXoo6 transposase  60.29 
 
 		 269 aa  164  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.714363  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0076  transposase IS4 family protein  43.5 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0258707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1110  transposase IS4 family protein  43.5 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00519  ISXoo6 transposase  59.71 
 
 		 307 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4863  transposase IS4 family protein  45.55 
 
 		 330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0853188  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  47.98 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1561  transposase IS4 family protein  43.5 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.983286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  48.65 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724993 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1662  transposase IS4 family protein  42.25 
 
 		 326 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.627269  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  57.04 
 
 		 330 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0210  transposase IS4 family protein  42.25 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0489  transposase IS4 family protein  42.25 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0714  transposase IS4 family protein  42.25 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1467  transposase IS4 family protein  42.25 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0317213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1565  transposase IS4 family protein  42.25 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.004757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1627  transposase IS4 family protein  42.25 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0994008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1816  transposase IS4 family protein  42.25 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2310  transposase IS4 family protein  42.25 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2314  transposase IS4 family protein  42.25 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0761785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2619  transposase IS4 family protein  42.25 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2970  transposase IS4 family protein  42.25 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.646128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3076  transposase IS4 family protein  42.25 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3325  transposase IS4 family protein  42.25 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3346  transposase IS4 family protein  42.25 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3107  transposase IS4 family protein  42.25 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04736  ISXoo6 transposase  58.99 
 
 		 307 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  48 
 
 		 326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0206  TIS1021 transposase  45.96 
 
 		 328 aa  161  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1179  TIS1021 transposase  45.96 
 
 		 328 aa  161  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0603  transposase, IS4 family protein  46.27 
 
 		 314 aa  161  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0947  IS5 transposase  45.95 
 
 		 326 aa  161  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2016  transposase, IS4 family protein  47.34 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  45.5 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  46 
 
 		 327 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2444  TIS1021-transposase protein  45 
 
 		 337 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3223  IS52, transposase  44.9 
 
 		 325 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3528  IS52, transposase  44.9 
 
 		 325 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4725  IS52, transposase  44.9 
 
 		 325 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2295  transposase IS4 family protein  46.15 
 
 		 327 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2538  TIS1021-transposase protein  45 
 
 		 337 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1753  transposase, IS4 family protein  55 
 
 		 327 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.808639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0854  TIS1021-transposase protein  45 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3327  TIS1021-transposase protein  45 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2992  TIS1021-transposase protein  45 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3819  TIS1021-transposase protein  45 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2600  TIS1021-transposase protein  45 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.90039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2965  TIS1021-transposase protein  45 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0493876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2596  TIS1021-transposase protein  45 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2990  TIS1021-transposase protein  45 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1053  TIS1021-transposase protein  45 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.420746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2988  TIS1021-transposase protein  45 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2612  transposase IS4 family protein  43.3 
 
 		 330 aa  158  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4057  transposase IS4 family protein  43.3 
 
 		 330 aa  158  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4760  transposase IS4 family protein  43.3 
 
 		 330 aa  158  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3555  transposase IS4 family protein  43.3 
 
 		 330 aa  158  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5581  transposase IS4 family protein  43.3 
 
 		 330 aa  158  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5619  transposase IS4 family protein  43.3 
 
 		 330 aa  158  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5567  transposase IS4 family protein  43.3 
 
 		 330 aa  158  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60838 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5692  transposase IS4 family protein  43.3 
 
 		 330 aa  158  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>