More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3793 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  100 
 
 		 326 aa  681    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4823  transposase IS4 family protein  93.25 
 
 		 326 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  85.89 
 
 		 327 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  77.37 
 
 		 326 aa  521  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  77.37 
 
 		 326 aa  521  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  77.37 
 
 		 326 aa  521  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  77.37 
 
 		 326 aa  521  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  77.12 
 
 		 326 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  75.84 
 
 		 327 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32190  Transposase, IS4 protein  74.92 
 
 		 326 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0171  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0534  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0780  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0844  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0902  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0903  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1166  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1188  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.584401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1229  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.520476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1310  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1315  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2008  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2010  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2234  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2324  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000979415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2328  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00380976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2426  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2432  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000860937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2541  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2836  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2887  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00537517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3194  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0837027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3208  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 338 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0135274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3731  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0359746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3963  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4152  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4253  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4347  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4596  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4643  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4702  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4971  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5428  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5440  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5556  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5564  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5582  ISPssy, transposase  73.31 
 
 		 325 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  63.84 
 
 		 327 aa  418  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02301  ISXoo6 transposase  65.31 
 
 		 326 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01501  ISXoo6 transposase  64.38 
 
 		 331 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04439  ISXoo6 transposase  64.89 
 
 		 320 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03937  ISXoo6 transposase  65 
 
 		 405 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03428  ISXoo6 transposase  65.3 
 
 		 320 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1407  ISPssy transposase or derivative  71.74 
 
 		 279 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286806  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01370  ISXoo6 transposase  64.06 
 
 		 329 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02738  ISXo1 transposase  63.01 
 
 		 322 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05639  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  401  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01500  ISXo1 transposase  63.01 
 
 		 322 aa  403  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.549499  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01751  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06239  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06088  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01080  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000904995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05516  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05577  ISXo1 transposase  62.38 
 
 		 322 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05625  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0316217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01862  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04767  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04850  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0577284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04722  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04707  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04676  ISXo1 transposase  62.38 
 
 		 322 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04603  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03194  ISXo1 transposase  62.38 
 
 		 322 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04034  ISXo1 transposase  62.07 
 
 		 322 aa  397  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00267  ISXo1 transposase  62.38 
 
 		 322 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00284  ISXo1 transposase  62.38 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.454777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00278  ISXo1 transposase  62.38 
 
 		 322 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02304  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04748  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04167  ISXo1 transposase  62.38 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05689  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01858  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00491  ISXo1 transposase  62.7 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05526  ISXo1 transposase  62.38 
 
 		 322 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00368  ISXo1 transposase  62.38 
 
 		 322 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.161909  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0800  IS5 transposase  59.22 
 
 		 326 aa  388  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0569  IS5 transposase  59.22 
 
 		 326 aa  388  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0489  transposase IS4 family protein  58.65 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1565  transposase IS4 family protein  58.65 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.004757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1627  transposase IS4 family protein  58.65 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0994008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1816  transposase IS4 family protein  58.65 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2276  transposase IS4 family protein  58.71 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.540999  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2314  transposase IS4 family protein  58.65 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0761785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2619  transposase IS4 family protein  58.65 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2970  transposase IS4 family protein  58.65 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.646128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3076  transposase IS4 family protein  58.65 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00519  ISXoo6 transposase  64.55 
 
 		 307 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3107  transposase IS4 family protein  58.65 
 
 		 326 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2257  IS5 transposase  58.71 
 
 		 330 aa  386  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0642  IS5 transposase  58.71 
 
 		 330 aa  386  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0956986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>