More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1704 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1704  ISRSO18-transposase protein  100 
 
 		 321 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0125656  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1136  ISRSO18-transposase protein  91.9 
 
 		 321 aa  614  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.835296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  69.14 
 
 		 330 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2927  transposase, IS4 family protein  69.09 
 
 		 319 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3426  transposase, IS4 family protein  65.93 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2004  transposase, IS4 family protein  65.93 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.094383  normal  0.686139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2954  transposase, IS4 family protein  65.93 
 
 		 320 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3766  transposase, IS4 family protein  65.93 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3096  transposase, IS4 family protein  65.93 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0728273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1459  transposase, IS4 family protein  65.93 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0590  transposase, IS4 family protein  65.93 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.605879  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5648  transposase IS4 family protein  66.77 
 
 		 320 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3367  transposase, IS4 family protein  65.93 
 
 		 326 aa  442  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105389  normal  0.324658 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1557  transposase, IS4 family protein  65.09 
 
 		 320 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3395  transposase, IS4 family protein  65.54 
 
 		 328 aa  433  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2494  transposase, IS4 family protein  65.09 
 
 		 320 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0455823  decreased coverage  0.00299337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3460  transposase, IS4 family protein  65.09 
 
 		 320 aa  433  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2295  transposase IS4 family protein  67.62 
 
 		 327 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1753  transposase, IS4 family protein  64.2 
 
 		 327 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.808639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0605  ISRSO18-transposase protein  64.78 
 
 		 319 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0382  ISRSO18-transposase protein  64.78 
 
 		 319 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2598  ISRSO18-transposase protein  63.72 
 
 		 319 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  59.93 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01370  ISXoo6 transposase  60.19 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  59.93 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01501  ISXoo6 transposase  60.19 
 
 		 331 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543852  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  59.93 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  59.93 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  59.61 
 
 		 326 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  57.73 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0171  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0534  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0780  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0844  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0902  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0903  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1166  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1188  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.584401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1229  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.520476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1310  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1315  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02301  ISXoo6 transposase  60.52 
 
 		 326 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2008  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2010  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2234  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2324  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000979415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2328  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00380976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2426  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2432  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000860937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2541  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2836  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2887  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00537517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3194  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0837027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3208  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0135274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3731  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0359746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3963  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4152  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4253  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4347  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4596  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4643  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4702  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4971  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5428  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5440  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5556  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5564  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5582  ISPssy, transposase  58.71 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  56.66 
 
 		 327 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03937  ISXoo6 transposase  60.19 
 
 		 405 aa  368  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03428  ISXoo6 transposase  60.93 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04439  ISXoo6 transposase  60.33 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  59.55 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01080  ISXo1 transposase  59.02 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000904995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02304  ISXo1 transposase  58.69 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01751  ISXo1 transposase  58.69 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01500  ISXo1 transposase  59.02 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.549499  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01862  ISXo1 transposase  59.02 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04722  ISXo1 transposase  59.02 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01858  ISXo1 transposase  59.02 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02738  ISXo1 transposase  59.02 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04167  ISXo1 transposase  58.69 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03194  ISXo1 transposase  58.69 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05625  ISXo1 transposase  59.02 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0316217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00368  ISXo1 transposase  59.02 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.161909  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00284  ISXo1 transposase  58.69 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.454777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06088  ISXo1 transposase  59.02 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05516  ISXo1 transposase  59.02 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04707  ISXo1 transposase  59.02 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05577  ISXo1 transposase  58.69 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04748  ISXo1 transposase  59.02 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04767  ISXo1 transposase  58.69 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05689  ISXo1 transposase  59.02 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05526  ISXo1 transposase  58.69 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00267  ISXo1 transposase  58.69 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00278  ISXo1 transposase  58.69 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04850  ISXo1 transposase  59.02 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0577284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00491  ISXo1 transposase  59.02 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04603  ISXo1 transposase  59.02 
 
 		 322 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04676  ISXo1 transposase  58.69 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>