224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2502 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0521  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  852    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0892728  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0709  hypothetical protein  98.77 
 
 
406 aa  842    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0720  hypothetical protein  99.26 
 
 
406 aa  846    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0741  hypothetical protein  99.26 
 
 
406 aa  847    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.420464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1056  hypothetical protein  99.26 
 
 
406 aa  847    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1166  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  852    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1343  hypothetical protein  99.26 
 
 
406 aa  847    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1747  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  852    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1881  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  852    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2465  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  852    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.712536  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2502  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  852    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2001  hypothetical protein  98.96 
 
 
288 aa  600  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0138  hypothetical protein  63.79 
 
 
406 aa  552  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0534  transposase, IS4 family protein  47.24 
 
 
411 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0503  transposase IS4 family protein  45.19 
 
 
399 aa  357  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1658  transposase IS4 family protein  45.59 
 
 
399 aa  355  8.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0523  transposase IS4 family protein  45.59 
 
 
399 aa  355  8.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.229183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2313  transposase IS4 family protein  45.59 
 
 
399 aa  355  8.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2979  hypothetical protein  55.76 
 
 
164 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.492693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0375  transposase IS1182 family protein  27.03 
 
 
452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0929  transposase IS1182 family protein  27.03 
 
 
452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0831  transposase IS1182 family protein  27.03 
 
 
452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000267898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1527  transposase IS1182 family protein  27.03 
 
 
452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0432  transposase, IS4 family protein  24.65 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0215  transposase, IS4 family protein  24.65 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0218  transposase, IS4 family protein  24.65 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0399  transposase, IS4 family protein  24.65 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.646351  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0428  transposase, IS4 family protein  24.65 
 
 
443 aa  99.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2194  transposase, IS4 family protein  24.65 
 
 
443 aa  98.2  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0587  transposase, IS4 family protein  24.65 
 
 
443 aa  98.2  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1503  transposase, IS4 family protein  24.65 
 
 
443 aa  98.2  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1502  transposase, IS4 family protein  24.65 
 
 
443 aa  98.2  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.342679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1735  transposase, IS4 family protein  24.65 
 
 
443 aa  98.2  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0159  transposase, IS4 family protein  24.65 
 
 
443 aa  98.2  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0173  transposase, IS4 family protein  24.65 
 
 
443 aa  98.2  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1752  transposase, IS4 family protein  24.65 
 
 
443 aa  98.2  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1246  transposase, IS4 family protein  24.42 
 
 
443 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000500369  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0257  transposase, IS4 family protein  24.42 
 
 
443 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.251859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4663  transposase IS1182 family protein  30.71 
 
 
452 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0188  transposase IS1182 family protein  30.71 
 
 
452 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0978  transposase IS1182 family protein  30.71 
 
 
452 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0965  transposase IS1182 family protein  30.71 
 
 
452 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2214  transposase I1182 family protein  30.71 
 
 
452 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0088029  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0152  hypothetical protein  32.56 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000580282  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1705  hypothetical protein  32.09 
 
 
495 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  31.07 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  31.07 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  31.07 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  31.07 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  31.07 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  31.07 
 
 
320 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  32.21 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2852  hypothetical protein  37.62 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00308029  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  27.43 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1941  hypothetical protein  26.18 
 
 
472 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1267  transposase IS4 family protein  26.45 
 
 
274 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2748  transposase, IS4  25.93 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1315  hypothetical protein  26.18 
 
 
472 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00094296  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0655  transposase IS4 family protein  24.77 
 
 
311 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.927973  normal  0.11164 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3344  transposase IS4 family protein  26.02 
 
 
336 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1704  ISRSO18-transposase protein  29.47 
 
 
321 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0125656  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  23.27 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  23.27 
 
 
360 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  27.23 
 
 
334 aa  57  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36450  Transposase, IS4  24.31 
 
 
335 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26840  Transposase, IS4  24.31 
 
 
335 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24660  Transposase, IS4  24.31 
 
 
335 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49770  IS4 family transposase  24.31 
 
 
335 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16640  Transposase, IS4  24.31 
 
 
335 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1110  transposase IS4 family protein  29.38 
 
 
321 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0076  transposase IS4 family protein  29.38 
 
 
321 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0258707  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1561  transposase IS4 family protein  29.38 
 
 
321 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.983286 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1136  ISRSO18-transposase protein  28.02 
 
 
321 aa  53.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.835296  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0604  transposase, IS4 family protein  29.02 
 
 
314 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3712  transposase, IS4 family protein  29.02 
 
 
314 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3832  transposase, IS4 family protein  29.02 
 
 
314 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4142  IS4 family transposase  24.76 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.282209 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  27.78 
 
 
316 aa  51.2  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3193  hypothetical protein  26.07 
 
 
304 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0691373  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0222  transposase IS4 family protein  24.34 
 
 
348 aa  50.1  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0960  hypothetical protein  23.56 
 
 
461 aa  48.9  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24710  Transposase, IS4  23.39 
 
 
335 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1178  hypothetical protein  23.33 
 
 
512 aa  48.9  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.216502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3314  IS5 transposase  26.84 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4707  IS5 transposase  26.84 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  22.89 
 
 
281 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2276  transposase IS4 family protein  26.84 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.540999  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4088  IS5 transposase  26.84 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0322419  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.42 
 
 
281 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  24.64 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0652  IS5 transposase  26.84 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0642  IS5 transposase  26.84 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0956986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2257  IS5 transposase  26.84 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1172  hypothetical protein  23.56 
 
 
462 aa  48.9  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0849908 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3892  transposase IS4 family protein  26.84 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  26.06 
 
 
445 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  26.41 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  26.69 
 
 
330 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  24.64 
 
 
338 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1124  IS5 transposase  26.84 
 
 
326 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.756281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>