More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0222 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0222  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 348 aa  726    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0712  transposase IS4 family protein  80.98 
 
 		 352 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0829  transposase IS4 family protein  80.12 
 
 		 352 aa  600  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2324  transposase IS4 family protein  78.74 
 
 		 348 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2450  transposase IS4 family protein  78.74 
 
 		 348 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.348584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1665  transposase IS4 family protein  73.18 
 
 		 367 aa  532  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114037  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1361  transposase IS4 family protein  83.9 
 
 		 240 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.873798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2457  transposase IS4 family protein  50.76 
 
 		 338 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000063174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3091  transposase IS4 family protein  50.76 
 
 		 338 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2638  transposase IS4 family protein  50.76 
 
 		 338 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0500483  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4812  transposase IS4 family protein  44.6 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1196  IS5 family transposase  46.83 
 
 		 334 aa  294  2e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5319  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 		 353 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.316405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1747  transposase IS4 family protein  40.23 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0147  IS5 family transposase  43.83 
 
 		 316 aa  249  5e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0337  transposase IS4 family protein  35.88 
 
 		 345 aa  222  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5109  IS4 family transposase  37.46 
 
 		 358 aa  222  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0975401  normal  0.0840327 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0260  transposase IS4 family protein  35.59 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16640  Transposase, IS4  36.45 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24660  Transposase, IS4  36.45 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49770  IS4 family transposase  36.45 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36450  Transposase, IS4  36.45 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26840  Transposase, IS4  36.45 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24710  Transposase, IS4  35.54 
 
 		 335 aa  216  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0479  transposase IS4 family protein  34.41 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1943  transposase IS4 family protein  34.41 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0044381  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0318  transposase IS4 family protein  37.37 
 
 		 314 aa  199  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2971  IS1246 transposase  38.03 
 
 		 280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3123  transposase IS4 family protein  32.31 
 
 		 360 aa  179  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0955  transposase IS4 family protein  32.31 
 
 		 360 aa  179  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0398  transposase, IS4  31.23 
 
 		 313 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3293  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0756  transposase, IS4  31.23 
 
 		 313 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.443512  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0912  transposase, IS4  31.23 
 
 		 313 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.216188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0918  transposase, IS4  31.23 
 
 		 313 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1991  transposase, IS4  31.23 
 
 		 313 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2442  transposase, IS4  30.93 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0131  transposase, IS4  30.93 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0566  transposase, IS4  30.93 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0567  transposase, IS4  30.93 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330478  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0584  transposase, IS4  30.93 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.810717  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0785  transposase, IS4  30.93 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1279  transposase, IS4  30.93 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1446  transposase, IS4  30.93 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1639  transposase, IS4  30.93 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1923  transposase, IS4  30.93 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2019  transposase, IS4  30.93 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2137  transposase, IS4  30.93 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2160  transposase, IS4  30.93 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2173  transposase, IS4  30.93 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460433  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0460  ISPg1, transposase  31.8 
 
 		 361 aa  152  5.9999999999999996e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_002950  PG0549  ISPg1, transposase  31.8 
 
 		 361 aa  152  5.9999999999999996e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1244  ISPg1, transposase  31.8 
 
 		 361 aa  152  5.9999999999999996e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2759  transposase (class II)  47.59 
 
 		 174 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.195506  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0184  ISPg1, transposase  31.19 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0825  ISPg1, transposase  31.19 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1031  ISPg1, transposase  31.19 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000307461 
 
 
-
 
NC_002950  PG1177  ISPg1, transposase  31.19 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1197  ISPg1, transposase  31.19 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_002950  PG1448  ISPg1, transposase  31.19 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1624  ISPg1, transposase  31.19 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1906  ISPg1, transposase  31.19 
 
 		 361 aa  151  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5532  IS4 family transposase  29.28 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4989  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1226  transposase, IS4  27.81 
 
 		 320 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0216  transposase, IS4  27.81 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4411  transposase, IS4  27.81 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0826  transposase, IS4  27.81 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.33945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0078  transposase, IS4  27.81 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  0.0332159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0213  transposase, IS4  27.81 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0925745 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2276  transposase, IS4  29.73 
 
 		 323 aa  133  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0942  transposase, IS4  28.44 
 
 		 322 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4916  transposase IS4 family protein  28.8 
 
 		 324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  28.21 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  28.21 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  27.86 
 
 		 349 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  27.86 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3425  transposase, IS4 family protein  35.4 
 
 		 233 aa  123  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4027  transposase, IS4 family protein  28.62 
 
 		 326 aa  123  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0970154  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5567  transposase IS4 family protein  27.68 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60838 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5692  transposase IS4 family protein  27.68 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5581  transposase IS4 family protein  27.68 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5619  transposase IS4 family protein  27.68 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3478  transposase IS4 family protein  27.68 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.594385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2612  transposase IS4 family protein  27.68 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6186  transposase IS4 family protein  27.68 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.62598 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4057  transposase IS4 family protein  27.68 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4760  transposase IS4 family protein  27.68 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3555  transposase IS4 family protein  27.68 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3712  transposase, IS4 family protein  28.3 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0604  transposase, IS4 family protein  28.3 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3832  transposase, IS4 family protein  28.3 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0206  TIS1021 transposase  27.52 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1179  TIS1021 transposase  27.52 
 
 		 328 aa  119  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4863  transposase IS4 family protein  26.91 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0853188  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1561  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.983286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1110  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0076  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0258707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1308  ISRSO18-transposase protein  25.68 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  26.23 
 
 		 316 aa  113  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2748  transposase, IS4  26.02 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>