More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2276 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2276  transposase, IS4  100 
 
 		 323 aa  673    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0942  transposase, IS4  86.96 
 
 		 322 aa  596  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5532  IS4 family transposase  77.81 
 
 		 320 aa  522  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4916  transposase IS4 family protein  76.54 
 
 		 324 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0714  hypothetical protein  86.34 
 
 		 216 aa  338  8e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1283  transposase, IS4 family protein  59.52 
 
 		 304 aa  318  7e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0076  transposase IS4 family protein  49.68 
 
 		 321 aa  312  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0258707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1110  transposase IS4 family protein  49.68 
 
 		 321 aa  312  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1561  transposase IS4 family protein  49.68 
 
 		 321 aa  312  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.983286 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3478  transposase IS4 family protein  48.41 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.594385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3555  transposase IS4 family protein  48.41 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2612  transposase IS4 family protein  48.41 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4057  transposase IS4 family protein  48.41 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5567  transposase IS4 family protein  48.41 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60838 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5619  transposase IS4 family protein  48.41 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5581  transposase IS4 family protein  48.41 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5692  transposase IS4 family protein  48.41 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4760  transposase IS4 family protein  48.41 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6186  transposase IS4 family protein  48.41 
 
 		 330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.62598 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0206  TIS1021 transposase  47.37 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1179  TIS1021 transposase  47.37 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2444  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 337 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2538  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 337 aa  300  3e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3327  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3819  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2600  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.90039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2596  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2992  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2965  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0493876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2990  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0854  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1053  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.420746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2988  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2350  ISPsy10, transposase, truncation  72.49 
 
 		 212 aa  297  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4863  transposase IS4 family protein  48.03 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0853188  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2016  transposase, IS4 family protein  49.53 
 
 		 330 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1308  ISRSO18-transposase protein  47.42 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  45.4 
 
 		 330 aa  286  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0618  ISRSO18-transposase protein  46.62 
 
 		 320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0210  transposase IS4 family protein  47.34 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0489  transposase IS4 family protein  47.34 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0714  transposase IS4 family protein  47.34 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1467  transposase IS4 family protein  47.34 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0317213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1565  transposase IS4 family protein  47.34 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.004757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1627  transposase IS4 family protein  47.34 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0994008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1816  transposase IS4 family protein  47.34 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2310  transposase IS4 family protein  47.34 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2314  transposase IS4 family protein  47.34 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0761785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2619  transposase IS4 family protein  47.34 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2970  transposase IS4 family protein  47.34 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.646128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3076  transposase IS4 family protein  47.34 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3325  transposase IS4 family protein  47.34 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3346  transposase IS4 family protein  47.34 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  44.76 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3107  transposase IS4 family protein  47.34 
 
 		 326 aa  279  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2295  transposase IS4 family protein  47.35 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  45.85 
 
 		 316 aa  278  8e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1662  transposase IS4 family protein  47.02 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.627269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2276  transposase IS4 family protein  46.5 
 
 		 326 aa  276  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.540999  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0605  ISRSO18-transposase protein  46.69 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0382  ISRSO18-transposase protein  46.69 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  43.38 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0642  IS5 transposase  46.54 
 
 		 330 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0956986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2257  IS5 transposase  46.54 
 
 		 330 aa  275  6e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4823  transposase IS4 family protein  45.37 
 
 		 326 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  47.19 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  44.1 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04439  ISXoo6 transposase  47.5 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0652  IS5 transposase  46.23 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0023  IS5 transposase  46.23 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.938635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1124  IS5 transposase  46.23 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0934  IS5 transposase  46.23 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1856  IS5 transposase  46.23 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.859503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2076  IS5 transposase  46.23 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3314  IS5 transposase  46.23 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4707  IS5 transposase  46.23 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4088  IS5 transposase  46.23 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0322419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4726  IS5 transposase  46.23 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  43.25 
 
 		 326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  43.25 
 
 		 326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  43.25 
 
 		 326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  43.25 
 
 		 326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02301  ISXoo6 transposase  47.81 
 
 		 326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3832  transposase, IS4 family protein  44.84 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3712  transposase, IS4 family protein  44.84 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3838  transposase, IS4 family protein  44.34 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231978 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2598  ISRSO18-transposase protein  46.69 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0604  transposase, IS4 family protein  44.84 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0800  IS5 transposase  45.2 
 
 		 326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0569  IS5 transposase  45.2 
 
 		 326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01501  ISXoo6 transposase  47.19 
 
 		 331 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1753  transposase, IS4 family protein  43.03 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.808639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01747  IS5 transposase  44.44 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02453  IS5 transposase  44.44 
 
 		 326 aa  272  5.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0522589  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3223  IS52, transposase  44.03 
 
 		 325 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3528  IS52, transposase  44.03 
 
 		 325 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4725  IS52, transposase  44.03 
 
 		 325 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03428  ISXoo6 transposase  47.8 
 
 		 320 aa  272  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3892  transposase IS4 family protein  46.23 
 
 		 326 aa  272  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4268  transposase, IS4  44.67 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.45537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>