More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0942 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0942  transposase, IS4  100 
 
 		 322 aa  672    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2276  transposase, IS4  86.96 
 
 		 323 aa  596  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5532  IS4 family transposase  80.31 
 
 		 320 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4916  transposase IS4 family protein  79.01 
 
 		 324 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.387666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0714  hypothetical protein  90.16 
 
 		 216 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0076  transposase IS4 family protein  50.97 
 
 		 321 aa  316  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0258707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1561  transposase IS4 family protein  50.97 
 
 		 321 aa  316  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.983286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1110  transposase IS4 family protein  50.97 
 
 		 321 aa  316  4e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0206  TIS1021 transposase  48.46 
 
 		 328 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1179  TIS1021 transposase  48.46 
 
 		 328 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5619  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.659177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2612  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5567  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60838 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5581  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4057  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4760  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3555  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3478  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.594385 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6186  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.62598 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5692  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1283  transposase, IS4 family protein  56.66 
 
 		 304 aa  305  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2444  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2538  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2992  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3819  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3327  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2990  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2596  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2965  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0493876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2988  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0854  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1053  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.420746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2600  TIS1021-transposase protein  48.05 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.90039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2350  ISPsy10, transposase, truncation  73.54 
 
 		 212 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4863  transposase IS4 family protein  48.69 
 
 		 330 aa  294  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0853188  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2016  transposase, IS4 family protein  47.27 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  45.26 
 
 		 330 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1308  ISRSO18-transposase protein  47.81 
 
 		 320 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  46.23 
 
 		 316 aa  285  7e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0210  transposase IS4 family protein  47.17 
 
 		 326 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0489  transposase IS4 family protein  47.17 
 
 		 326 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0714  transposase IS4 family protein  47.17 
 
 		 326 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1467  transposase IS4 family protein  47.17 
 
 		 326 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0317213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1565  transposase IS4 family protein  47.17 
 
 		 326 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.004757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1627  transposase IS4 family protein  47.17 
 
 		 326 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0994008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1816  transposase IS4 family protein  47.17 
 
 		 326 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2310  transposase IS4 family protein  47.17 
 
 		 326 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2314  transposase IS4 family protein  47.17 
 
 		 326 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0761785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2619  transposase IS4 family protein  47.17 
 
 		 326 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2970  transposase IS4 family protein  47.17 
 
 		 326 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.646128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3076  transposase IS4 family protein  47.17 
 
 		 326 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3325  transposase IS4 family protein  47.17 
 
 		 326 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3346  transposase IS4 family protein  47.17 
 
 		 326 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3107  transposase IS4 family protein  47.17 
 
 		 326 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0618  ISRSO18-transposase protein  46.58 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0605  ISRSO18-transposase protein  46.93 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012005 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0382  ISRSO18-transposase protein  46.93 
 
 		 319 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1662  transposase IS4 family protein  46.86 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.627269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2276  transposase IS4 family protein  48.24 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.540999  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  45.09 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32190  Transposase, IS4 protein  45.71 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  45.09 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  45.09 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2598  ISRSO18-transposase protein  47.4 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  45.09 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0642  IS5 transposase  47.76 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0956986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2257  IS5 transposase  47.76 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  47.35 
 
 		 327 aa  278  7e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0171  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0534  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0780  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0844  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0902  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0903  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1166  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1188  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.584401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1229  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.520476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1310  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1315  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2008  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2010  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2234  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2324  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000979415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2328  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00380976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2426  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2432  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000860937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2541  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2836  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2887  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00537517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3194  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0837027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3208  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 338 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0135274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4347  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4596  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4643  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4702  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4971  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5428  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5440  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5556  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5564  ISPssy, transposase  45.4 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>